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Enregistrement W2042271587 · doi:10.4212/cjhp.v68i2.1439

Risk Factors for and Outcomes of Bacteremia Caused by Extended-Spectrum ß-Lactamase– Producing Escherichia coli and Klebsiella Species at a Canadian Tertiary Care Hospital

2015· article· en· W2042271587 sur OpenAlexaffvenueabout
My-Linh Nguyen, Baldwin Toye, Salmaan Kanji, Rosemary Zvonar

Notice bibliographique

RevueThe Canadian Journal of Hospital Pharmacy · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueAntibiotic Resistance in Bacteria
Établissements canadiensOttawa Hospital
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBacteremiaMedicineOdds ratioEmpiric therapyIntensive care unitInternal medicineRetrospective cohort studyAntimicrobialIntensive care medicineAntibioticsMortality rateMicrobiologyBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background: Antimicrobial resistance due to production of extendedspectrum ß-lactamases by Escherichia coli and Klebsiella species (ESBL-EK) is concerning. Previous studies have shown that bacteremia due to ESBLproducing organisms is associated with increases in length of stay and/or mortality rate. Rates of infection by ESBL-EK vary worldwide, and regional differences in the prevalence of risk factors are likely. Few Canadian studies assessing risk factors for ESBL-EK infections or the outcomes of empiric therapy have been published.Objectives: To determine risk factors for and patient outcomes associated with ESBL-EK bacteremia. The appropriateness of empiric antibiotic therapy and the effect of inappropriate empiric therapy on these outcomes were also examined.Methods: In a retrospective, 1:1 case–control study conducted in a tertiary care hospital between 2005 and 2010, data for 40 patients with ESBL-EK bacteremia were compared with data for 40 patients who had non-ESBL-EK bacteremia.Results: Of all variables tested, only antibiotic use within the previous 3 months was found to be an independent risk factor for acquisition of ESBL-EK bacteremia (odds ratio 5.2, 95% confidence interval 1.6–16.9). A greater proportion of patients with non-ESBL-EK bacteremia received appropriate empiric therapy (88% [35/40] versus 15% [6/40], p < 0.001). Time to appropriate therapy was longer for those with ESBL-EK bacteremia (2.42 days versus 0.17 day, p < 0.001). Patient outcomes, including length of stay in hospital, admission to the intensive care unit (ICU), length of stay in the ICU (if applicable), and in-hospital mortality were not affected by the presence of ESBL-EK or the appropriateness of empiric therapy.Conclusions: Previous antibiotic use was a significant, independent risk factor for acquiring ESBL-EK. Thus, prior antibiotic use is an important consideration in the selection of empiric antibiotic therapy and should increase the concern for resistant pathogens.RÉSUMÉContexte : La résistance aux antimicrobiens attribuable à la production de ß-lactamases à spectre étendu (BLSE) par les espèces Escherichia coli et Klebsiella est préoccupante. Des études antérieures ont démontré que les bactériémies causées par les organismes producteurs de BLSE sont associées à une augmentation de la durée du séjour à l’hôpital ou du taux de mortalité. Les taux d’infection par les espèces E. coli ou Klebsiella productrices de BLSE varient de par le monde et les différences régionales de la prévalence des facteurs de risque sont vraisemblables. Peu d’études canadiennes évaluant les facteurs de risque de ces infections ou les résultats cliniques des antibiothérapies empiriques ont été publiées.Objectifs : Déterminer quels sont les facteurs de risque des bactériémies à E. coli ou à Klebsiella productrices de BLSE ainsi que les résultats cliniques associés à ces bactériémies. De plus, étudier la pertinence de l’antibiothérapie empirique ainsi que l’effet d’une antibiothérapieempirique inappropriée sur ces résultats.Méthodes : Au cours d’une étude cas-témoins rétrospective d’un ratio de 1 pour 1 et réalisée dans un centre hosptalier de soins tertiaires entre 2005 et 2010, les données de 40 patients présentant une bactériémie à E. coli ou Klebsiella productrices de BLSE ont été comparées aux données de patients présentant une bactériémie à organisme non producteur de BLSE.Résultats : Parmi toutes les variables évaluées, seul l’emploi d’une antibiothérapie dans les trois derniers mois s'est révélé être un facteur de risque indépendant du développement d’une bactériémie à E. coli ou Klebsiella productrices de BLSE (risque relatif approché de 5,2, intervalle de confiance à 95 % de 1,6–16,9). Une plus grande proportion de patients présentant une bactériémie autre que celles à E. coli ou Klebsiella productrices de BLSE ont reçu une antibiothérapie empirique appropriée (88 % [35/40] contre 15 % [6/40], p < 0,001). Le temps requis pour trouver le traitement adéquat était plus long pour ceux présentant une bactériémie à E. coli ou Klebsiella productrices de BLSE (2,42 jours contre 0,17 jour, p < 0,001). La présence des espèces E. coli ou Klebsiella productrices de BLSE de même que la pertinence d’une antibiothérapie empirique n’ont pas eu de répercussion sur les résultats cliniques, notamment la durée du séjour à l’hôpital, l’admission à l’unité des soins intensifs (USI), la durée du séjour à l’USI (le cas échéant) ainsi que le taux de mortalité en hôpital.Conclusions : L’emploi d’une antibiothérapie préalable représentait un important facteur de risque indépendant de la survenue des espèces E. coli ou Klebsiella productrices de BLSE. Ce faisant, l’emploi d’une antibiothérapie préalable représente un facteur important à considérer au moment du choix d’une antibiothérapie empirique et devrait rendre sensible aux dangers des pathogènes résistants.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,240
Score d'incertitude au seuil0,483

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0010,002
Études des sciences et des technologies0,0020,001
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,239
Écart entre enseignants0,229 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations20
Publié2015
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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