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Record W2042271587 · doi:10.4212/cjhp.v68i2.1439

Risk Factors for and Outcomes of Bacteremia Caused by Extended-Spectrum ß-Lactamase– Producing Escherichia coli and Klebsiella Species at a Canadian Tertiary Care Hospital

2015· article· en· W2042271587 on OpenAlexaffvenueabout
My-Linh Nguyen, Baldwin Toye, Salmaan Kanji, Rosemary Zvonar

Bibliographic record

VenueThe Canadian Journal of Hospital Pharmacy · 2015
Typearticle
Languageen
FieldBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
TopicAntibiotic Resistance in Bacteria
Canadian institutionsOttawa Hospital
Fundersnot available
KeywordsBacteremiaMedicineOdds ratioEmpiric therapyIntensive care unitInternal medicineRetrospective cohort studyAntimicrobialIntensive care medicineAntibioticsMortality rateMicrobiologyBiology

Abstract

fetched live from OpenAlex

Background: Antimicrobial resistance due to production of extendedspectrum ß-lactamases by Escherichia coli and Klebsiella species (ESBL-EK) is concerning. Previous studies have shown that bacteremia due to ESBLproducing organisms is associated with increases in length of stay and/or mortality rate. Rates of infection by ESBL-EK vary worldwide, and regional differences in the prevalence of risk factors are likely. Few Canadian studies assessing risk factors for ESBL-EK infections or the outcomes of empiric therapy have been published.Objectives: To determine risk factors for and patient outcomes associated with ESBL-EK bacteremia. The appropriateness of empiric antibiotic therapy and the effect of inappropriate empiric therapy on these outcomes were also examined.Methods: In a retrospective, 1:1 case–control study conducted in a tertiary care hospital between 2005 and 2010, data for 40 patients with ESBL-EK bacteremia were compared with data for 40 patients who had non-ESBL-EK bacteremia.Results: Of all variables tested, only antibiotic use within the previous 3 months was found to be an independent risk factor for acquisition of ESBL-EK bacteremia (odds ratio 5.2, 95% confidence interval 1.6–16.9). A greater proportion of patients with non-ESBL-EK bacteremia received appropriate empiric therapy (88% [35/40] versus 15% [6/40], p < 0.001). Time to appropriate therapy was longer for those with ESBL-EK bacteremia (2.42 days versus 0.17 day, p < 0.001). Patient outcomes, including length of stay in hospital, admission to the intensive care unit (ICU), length of stay in the ICU (if applicable), and in-hospital mortality were not affected by the presence of ESBL-EK or the appropriateness of empiric therapy.Conclusions: Previous antibiotic use was a significant, independent risk factor for acquiring ESBL-EK. Thus, prior antibiotic use is an important consideration in the selection of empiric antibiotic therapy and should increase the concern for resistant pathogens.RÉSUMÉContexte : La résistance aux antimicrobiens attribuable à la production de ß-lactamases à spectre étendu (BLSE) par les espèces Escherichia coli et Klebsiella est préoccupante. Des études antérieures ont démontré que les bactériémies causées par les organismes producteurs de BLSE sont associées à une augmentation de la durée du séjour à l’hôpital ou du taux de mortalité. Les taux d’infection par les espèces E. coli ou Klebsiella productrices de BLSE varient de par le monde et les différences régionales de la prévalence des facteurs de risque sont vraisemblables. Peu d’études canadiennes évaluant les facteurs de risque de ces infections ou les résultats cliniques des antibiothérapies empiriques ont été publiées.Objectifs : Déterminer quels sont les facteurs de risque des bactériémies à E. coli ou à Klebsiella productrices de BLSE ainsi que les résultats cliniques associés à ces bactériémies. De plus, étudier la pertinence de l’antibiothérapie empirique ainsi que l’effet d’une antibiothérapieempirique inappropriée sur ces résultats.Méthodes : Au cours d’une étude cas-témoins rétrospective d’un ratio de 1 pour 1 et réalisée dans un centre hosptalier de soins tertiaires entre 2005 et 2010, les données de 40 patients présentant une bactériémie à E. coli ou Klebsiella productrices de BLSE ont été comparées aux données de patients présentant une bactériémie à organisme non producteur de BLSE.Résultats : Parmi toutes les variables évaluées, seul l’emploi d’une antibiothérapie dans les trois derniers mois s'est révélé être un facteur de risque indépendant du développement d’une bactériémie à E. coli ou Klebsiella productrices de BLSE (risque relatif approché de 5,2, intervalle de confiance à 95 % de 1,6–16,9). Une plus grande proportion de patients présentant une bactériémie autre que celles à E. coli ou Klebsiella productrices de BLSE ont reçu une antibiothérapie empirique appropriée (88 % [35/40] contre 15 % [6/40], p < 0,001). Le temps requis pour trouver le traitement adéquat était plus long pour ceux présentant une bactériémie à E. coli ou Klebsiella productrices de BLSE (2,42 jours contre 0,17 jour, p < 0,001). La présence des espèces E. coli ou Klebsiella productrices de BLSE de même que la pertinence d’une antibiothérapie empirique n’ont pas eu de répercussion sur les résultats cliniques, notamment la durée du séjour à l’hôpital, l’admission à l’unité des soins intensifs (USI), la durée du séjour à l’USI (le cas échéant) ainsi que le taux de mortalité en hôpital.Conclusions : L’emploi d’une antibiothérapie préalable représentait un important facteur de risque indépendant de la survenue des espèces E. coli ou Klebsiella productrices de BLSE. Ce faisant, l’emploi d’une antibiothérapie préalable représente un facteur important à considérer au moment du choix d’une antibiothérapie empirique et devrait rendre sensible aux dangers des pathogènes résistants.

Fetched live from OpenAlex and de-inverted. Abstracts are not stored in this database: the inverted indexes are 8.6 GB of the frame’s 9.3 GB of text, and the host has 13 GB free.

How this classification was reachedexpand

Full frame machine prediction

Teacher imitation

Not calibrated prevalence, not ground truth. Human validation pending. The Gemma side is a direct model label for every work in the frame, read from the title-only record. The Codex side is a classifier learned from the 10,348 direct Codex labels and calibrated to design-weighted sample rates; fields without enough sample support carry no Codex call. Candidate is the union of the two sides; consensus is their intersection. These outputs are machine_predicted_unvalidated and are not human labels.

metaresearch head score (Codex)0.001
metaresearch head score (Gemma)0.003
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cValidation status: machine_predicted_unvalidated
Candidate categoriesnone
Consensus categoriesnone
DomainCandidate signal: none · Consensus signal: none
Study designCandidate signal: Observational · Consensus signal: Observational
GenreCandidate signal: Empirical · Consensus signal: Empirical
Teacher disagreement score0.240
Threshold uncertainty score0.483

Distilled classifier scores by category (both heads)

CategoryCodexGemma
Metaresearch0.0010.003
Meta-epidemiology (narrow)0.0010.001
Meta-epidemiology (broad)0.0000.001
Bibliometrics0.0010.002
Science and technology studies0.0020.001
Scholarly communication0.0010.000
Open science0.0010.001
Research integrity0.0010.001
Insufficient payload (model declined to judge)0.0020.000

Machine scores (provisional)

The two teacher heads of the student model, read on this work. A score orders the frame for review; it never asserts a category, and the validation status ships verbatim with every row.

Baseline scores from an immature model (maturity gate not passed, 7 training rounds). Scores rank; they never assert a category.

Opus teacher head0.010
GPT teacher head0.239
Teacher spread0.229 · how far apart the two teachers sit on this one work
Validation statusscore_only:v0-immature-baseline · verbatim from the scoring run: score_only means the number may rank works, and no category label ships from it

Classification

machine, unvalidated

Machine predicted; a candidate call from one source (direct Gemma or distilled Codex), not a consensus.

The models applied no category: nothing in the taxonomy fit this work.
Study designObservational
Domainnot available
GenreEmpirical

How this classification was reached, model by model and score by score, is at the end of the page under "How this classification was reached".

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Citations20
Published2015
Admission routes3
Has abstractyes

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