Evolved tooth gain in sticklebacks is associated with a <i>cis</i> -regulatory allele of <i>Bmp6</i>
Notice bibliographique
Résumé
Developmental genetic studies of evolved differences in morphology have led to the hypothesis that cis-regulatory changes often underlie morphological evolution. However, because most of these studies focus on evolved loss of traits, the genetic architecture and possible association with cis-regulatory changes of gain traits are less understood. Here we show that a derived benthic freshwater stickleback population has evolved an approximate twofold gain in ventral pharyngeal tooth number compared with their ancestral marine counterparts. Comparing laboratory-reared developmental time courses of a low-toothed marine population and this high-toothed benthic population reveals that increases in tooth number and tooth plate area and decreases in tooth spacing arise at late juvenile stages. Genome-wide linkage mapping identifies largely separate sets of quantitative trait loci affecting different aspects of dental patterning. One large-effect quantitative trait locus controlling tooth number fine-maps to a genomic region containing an excellent candidate gene, Bone morphogenetic protein 6 (Bmp6). Stickleback Bmp6 is expressed in developing teeth, and no coding changes are found between the high- and low-toothed populations. However, quantitative allele-specific expression assays of Bmp6 in developing teeth in F1 hybrids show that cis-regulatory changes have elevated the relative expression level of the freshwater benthic Bmp6 allele at late, but not early, stages of stickleback development. Collectively, our data support a model where a late-acting cis-regulatory up-regulation of Bmp6 expression underlies a significant increase in tooth number in derived benthic sticklebacks.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».