Identification of a SAR8.2 gene in the susceptible host response of Nicotiana benthamiana to Colletotrichum orbiculare
Notice bibliographique
Résumé
A SAR8.2 gene, NbSAR8.2m, was obtained from a PCR-selected cDNA subtraction library constructed from mRNA of Nicotiana benthamiana Domin. infected with Colletotrichum orbiculare (Berk & Mont.) von Arx. It is the first SAR8.2 gene described from N. benthamiana and shows relatively high similarity in both the coding and 3'-UTR to NtSAR8.2m of Nicotiana tabacum L. Expression of NbSAR8.2m occurred in healthy plants but was induced 8-fold following infection by C. orbiculare. Virus-induced gene silencing of NbSAR8.2m reduced its expression and resulted in the development of disease symptoms 24 h earlier than in control plants, indicating that NbSAR8.2m affects the length of the biotrophic phase of infection. Both NtSAR8.2m and NbSAR8.2m are unique among the SAR8.2 genes in that they encode for four cysteines near the C-terminus. The conserved cysteines of SAR8.2 genes may indicate roles in stress responses, defence reactions, metal ion homeostasis or other processes.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».