Identification of the Motifs and Amino Acids in Aggrecan G1 and G2 Domains Involved in Product Secretion
Notice bibliographique
Résumé
Members of the large aggregating chondroitin sulfate proteoglycans are characterized by an N-terminal fragment known as G1 domain, which is composed of an immunoglobulin (IgG)-like motif and two tandem repeats (TR). Previous studies have indicated that the expressed product of aggrecan G1 domain was not secreted. Here we demonstrated that the inability of G1 secretion was associated with the tandem repeats but not the IgG-like motif, and specifically with TR1 of aggrecan. We also demonstrated that the G2 domain, a domain unique to aggrecan, had a similar effect on product secretion. The sequence of TR1 of G1 is highly conserved across species, which suggested similar functions played by these motifs. In a yeast two-hybrid assay, TR1 interacted with the calcium homeostasis endoplasmic reticulum protein. Deletion/mutation experiments indicated that the N-terminal fragment of TR1, in particular, the amino acids H(2)R(4) of this motif were key to its effect on product secretion. However, the N-terminal 55 amino acids were required to exert this function. Taken together, our study suggests a possible molecular mechanism for the function of the tandem repeats in product processing.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».