Structural Characterization of Closely Related O-antigen Lipopolysaccharide (LPS) Chain Length Regulators
Notice bibliographique
Résumé
The surface O-antigen polymers of Gram-negative bacteria exhibit a modal length distribution that depends on dedicated chain length regulator periplasmic proteins (polysaccharide co-polymerases, PCPs) anchored in the inner membrane by two transmembrane helices. In an attempt to determine whether structural changes underlie the O-antigen modal length specification, we have determined the crystal structures of several closely related PCPs, namely two chimeric PCP-1 family members solved at 1.6 and 2.8 Å and a wild-type PCP-1 from Shigella flexneri solved at 2.8 Å. The chimeric proteins form circular octamers, whereas the wild-type WzzB from S. flexneri was found to be an open trimer. We also present the structure of a WzzFepE mutant, which exhibits severe attenuation in its ability to produce very long O-antigen polymers. Our findings suggest that the differences in the modal length distribution depend primarily on the surface-exposed amino acids in specific regions rather than on the differences in the oligomeric state of the PCP protomers. The surface O-antigen polymers of Gram-negative bacteria exhibit a modal length distribution that depends on dedicated chain length regulator periplasmic proteins (polysaccharide co-polymerases, PCPs) anchored in the inner membrane by two transmembrane helices. In an attempt to determine whether structural changes underlie the O-antigen modal length specification, we have determined the crystal structures of several closely related PCPs, namely two chimeric PCP-1 family members solved at 1.6 and 2.8 Å and a wild-type PCP-1 from Shigella flexneri solved at 2.8 Å. The chimeric proteins form circular octamers, whereas the wild-type WzzB from S. flexneri was found to be an open trimer. We also present the structure of a WzzFepE mutant, which exhibits severe attenuation in its ability to produce very long O-antigen polymers. Our findings suggest that the differences in the modal length distribution depend primarily on the surface-exposed amino acids in specific regions rather than on the differences in the oligomeric state of the PCP protomers.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».