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Enregistrement W2043117828 · doi:10.1387/ijdb.062253lw

Soluble membrane-type 3 matrix metalloprioteinase causes changes in gene expression and increased gelatinase activity during Xenopus laevis development

2007· article· en· W2043117828 sur OpenAlexafffund
Logan A. Walsh, Colin A. Cooper, Sashko Damjanovski

Notice bibliographique

RevueThe International Journal of Developmental Biology · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueProtease and Inhibitor Mechanisms
Établissements canadiensWestern University
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésBiologyXenopusMatrix metalloproteinaseExtracellular matrixGelatinaseCell biologyEmbryoChordinGelatinase AFibronectinMolecular biologyGene expressionEmbryogenesisGeneGastrulationBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Matrix metalloproteinases (MMPs) are a family of endopeptidases that cleave and remodel the extracellular matrix (ECM). Membrane-type 3 MMP (MT3-MMP) is a membrane-anchored MMP, which has recently been shown to 'shed' from the cell surface in a soluble form upon proteolytic cleavage. Shed MT-MMPs can activate gelatinase-A in vitro and have been directly linked to the metastatic potential of many cancers. Here we examined the effect of ectopic expression of full-length tethered and shed (soluble) forms of MT3-MMP during Xenopus laevis development. Injection of mRNA coding for full-length tethered MT3-MMP resulted in the delayed onset of gastrulation and subsequent defects. Phenotype severity and the frequency of embryo death were dose-dependent. Dose-dependent defects were also observed with the injection of mRNA of the soluble form, but the phenotypes and frequencies of death were greater. Histological analysis of injected embryos demonstrated defects in the organization of axial structures, such as the neural tube and somites. Embryos injected with full-length MT3-MMP mRNA showed no significant changes in expression levels of the tissue specific genes endodermin, chordin and muscle actin when examined by semi-quantitative RT-PCR. In contrast, embryos injected with the soluble form of MT3-MMP exhibited decreased expression of these same marker genes. In addition, while full-length tethered MT3-MMP failed to alter gelatinase activity, a 50% increase was measured in response to injection of the soluble form, suggesting that the two forms of this protein could play distinct roles during embryogenesis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Étiquettes directes de modèles (non validées)

Étiquettes de catégorie et de devis d'étude par modèle, issues des rondes d'étiquetage. C'est une sortie machine, non validée, et le désaccord entre modèles est livré comme donnée. Aucun devis ici n'est encore validé contre MEDLINE.

BrasCatégoriesDevis d'étudeConfiance
gemmaaucune catégorie
Domaine: non disponible · Genre: Empirique
Porte sur le système de recherche canadien: non · Porte sur un sujet canadien: non
Expérimental (laboratoire)low
gptaucune catégorie
Domaine: non disponible · Genre: Empirique
Porte sur le système de recherche canadien: non · Porte sur un sujet canadien: non
Expérimental (laboratoire)low
modèles en accordL'accord compare des ensembles de catégories et des devis identiques entre les bras.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,426

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,267
Écart entre enseignants0,254 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Étiqueté directement par 2 modèles lisant le dossier complet.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations12
Publié2007
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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