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Enregistrement W2043195711 · doi:10.1111/jph.12301

<scp>SRAP</scp> as an Informative Molecular Marker to Study the <i>Fusarium poae</i> Genetic Variability

2014· article· en· W2043195711 sur OpenAlex
María I. Dinolfo, Eliana Castañares, Sebastián A. Stenglein

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

aboutLe titre ou le résumé porte un signal canadien du lexique géographique.
no affAucune affiliation canadienne : ce travail est invisible pour une base fondée sur la seule affiliation.
Aucune affiliation canadienne. Une base fondée sur la seule affiliation (le devis habituel) n'aurait jamais vu ce travail. C'est l'un des travaux qui justifient l'inversion de la base.

Notice bibliographique

RevueJournal of Phytopathology · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueMycotoxins in Agriculture and Food
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesUniversidad Nacional del Centro de la Provincia de Buenos AiresConsejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas
Mots-clésBiologyAnalysis of molecular varianceGenetic variabilityFusariumMolecular markerGeneticsGenetic variationGenetic structureGeneGenotype

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Fusarium poae is one of the Fusarium species isolated from grains associated with Fusarium head blight ( FHB ), whose occurrence has increased in the last years. In this study, a total of 105 F. poae isolates from Argentina, Belgium, Canada, England, Finland, France, Germany, Hungary, Italy, Luxembourg, Poland, Switzerland and Uruguay were evaluated using sequence‐related amplified polymorphism ( SRAP ) to analyse the capacity of this molecular marker to evaluate the F. poae genetic variability. The molecular analysis showed high intraspecific variability within F. poae isolates, and a partial relationship was revealed between variability and the host/geographic origin. Analysis of molecular variance ( amova ) indicated a high genetic variability in the F. poae collection, with most of the genetic variability resulting from differences within, rather than between American and European populations. The analysis of sequenced SRAP fragments targets into hypothetical proteins from different Fusarium species showing that the SRAP technique not only allows studying F. poae genetic variability, but also targets coding regions into the F. poae genome. To our knowledge, this is the first report on genetic variability of F. poae using SRAP technique and also demonstrates the efficacy of this molecular marker to amplify open reading frames in fungus.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,778
Score d'incertitude au seuil0,223

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,229
Écart entre enseignants0,221 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle