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Enregistrement W2043531610 · doi:10.1371/journal.pone.0021065

The p53 Tumor Suppressor Is Stabilized by Inhibitor of Growth 1 (ING1) by Blocking Polyubiquitination

2011· article· en· W2043531610 sur OpenAlexafffund
Subhash Thalappilly, Xiaolan Feng, Svitlana Pastyryeva, Daniel A. Muruve, Daniel Larocque, Matthias Truß, Andreas von Deimling, Karl Riabowol, Gesche Tallen

Notice bibliographique

RevuePLoS ONE · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueUbiquitin and proteasome pathways
Établissements canadiensMcGill UniversityGlaxoSmithKline (Canada)University of Calgary
Organismes subventionnairesAlberta Heritage Foundation for Medical ResearchBundesministerium für Bildung und ForschungCanadian Institutes of Health ResearchLeuka
Mots-clésDeubiquitinating enzymeUbiquitinUbiquitin ligaseBiologyDNA damageCell biologyGene knockdownMdm2DNABiochemistryApoptosisGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The INhibitor of Growth tumor suppressors (ING1-ING5) affect aging, apoptosis, DNA repair and tumorigenesis. Plant homeodomains (PHD) of ING proteins bind histones in a methylation-sensitive manner to regulate chromatin structure. ING1 and ING2 contain a polybasic region (PBR) adjacent to their PHDs that binds stress-inducible phosphatidylinositol monophosphate (PtIn-MP) signaling lipids to activate these INGs. ING1 induces apoptosis independently of p53 but other studies suggest proapoptotic interdependence of ING1 and p53 leaving their functional relationship unclear. Here we identify a novel ubiquitin-binding domain (UBD) that overlaps with the PBR of ING1 and shows similarity to previously described UBDs involved in DNA damage responses. The ING1 UBD binds ubiquitin with high affinity (K(d)∼100 nM) and ubiquitin competes with PtIn-MPs for ING1 binding. ING1 expression stabilized wild-type, but not mutant p53 in an MDM2-independent manner and knockdown of endogenous ING1 depressed p53 levels in a transcription-independent manner. ING1 stabilized unmodified and six multimonoubiquitinated forms of wild-type p53 that were also seen upon DNA damage, but not p53 mutants lacking the six known sites of ubiquitination. We also find that ING1 physically interacts with herpesvirus-associated ubiquitin-specific protease (HAUSP), a p53 and MDM2 deubiquitinase (DUB), and knockdown of HAUSP blocks the ability of ING1 to stabilize p53. These data link lipid stress signaling to ubiquitin-mediated proteasomal degradation through the PBR/UBD of ING1 and further indicate that ING1 stabilizes p53 by inhibiting polyubiquitination of multimonoubiquitinated forms via interaction with and colocalization of the HAUSP-deubiquitinase with p53.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,028
Tête enseignante GPT0,210
Écart entre enseignants0,182 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations44
Publié2011
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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