Characterization of Fluorescent Sterol Binding to Purified Human NPC1
Notice bibliographique
Résumé
Mutations in the NPC1 gene cause Niemann-Pick type C disease, which appears to result from a defect in intracellular cholesterol trafficking. NPC1 is a member of the resistance-nodulation-cell division (RND) permease superfamily and contains a sterol-sensing domain, yet its cellular function and the identity of its substrates remain unknown. FLAG-tagged human NPC1 was purified from NPC1-expressing Chinese hamster ovary cells by solubilization in 3-[(3-cholamidopropyl)dimethylammonio]-1-propanesulfonic acid (CHAPS), followed by affinity chromatography. Purified NPC1 in detergent solution appeared to be oligomeric as determined by gel filtration fast protein liquid chromatography and was photolabeled by an azido-cholesterol derivative. Fluorescent cholesterol analogs, including dehydroergosterol, cholestatrienol, and 22-(N-(7-nitrobenz-2-oxa-1,3-diazol-4-yl)amino)-23,24-bisnor-5-cholen-3beta-ol (NBD-cholesterol), displayed enhanced fluorescence upon binding to NPC1 and also resulted in saturable, concentration-dependent quenching of NPC1 intrinsic Trp fluorescence. The apparent binding affinity for these three sterols was in the 0.5-6 microm range. Binding of NBD-cholesterol to NPC1 at low detergent concentration (2 mm CHAPS) was of high apparent affinity (0.5-0.6 microm) and occurred rapidly (<1 min). However, binding of a BODIPY-labeled cholesterol derivative was very slow, requiring approximately 3 h to reach equilibrium. The apparent NBD-cholesterol binding affinity was greatly reduced at higher detergent concentration. The stoichiometry of NBD-cholesterol binding to NPC1 was approximately 1. Various sterols, including native cholesterol and 25-hydroxycholesterol, inhibited NBD-cholesterol binding, suggesting that they compete for binding to the protein. Dynamic quenching studies showed that bound NBD-cholesterol was almost completely shielded from the aqueous medium, suggesting that it is buried in a deep hydrophobic pocket in NPC1. The use of fluorescent cholesterol analogs provides novel information on the molecular properties of the sterol-binding site in the full-length NPC1 protein.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,006 | 0,003 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».