Modeling and functional analysis of AEBP1, a transcriptional repressor
Notice bibliographique
Résumé
Adipocyte enhancer binding protein 1 (AEBP1) is a transcriptional repressor of the aP2 gene, which encodes the adipocyte lipid binding protein and is involved in the differentiation of preadipocytes into mature adipocytes. It is an isoform of aortic carboxypeptidase-like protein (ACLP), which is a part of the extracellular matrix. AEBP1 and ACLP contain a conserved carboxypeptidase domain which is critical for the function of AEBP1 as a transcriptional repressor. Homology modeling and multiple alignment of AEBP1 homologues were performed to identify putative domains and critical residues that were then deleted or mutated in mouse AEBP1. Expression of wild-type and mutant AEBP1 proteins in CHO cells was performed, and their function in transcriptional repression was assayed by luciferase assay. All deletion forms of AEBP1 were able to repress transcription driven by the aP2 promoter. The DNA binding domain of AEBP1 was mapped by electrophoretic mobility shift assays to a region of the C-terminus rich in basic residues. However, wild-type AEBP1 was not able to interact strongly with DNA, suggesting that AEBP1 might function predominantly as a corepressor, independent of DNA binding. AEBP1 was also found to interact with Ca2+/calmodulin through this basic region, suggesting another mechanism of functional regulation.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».