F-Like Type IV Secretion Systems Encode Proteins with Thioredoxin Folds That Are Putative DsbC Homologues
Notice bibliographique
Résumé
F and R27 are conjugative plasmids of enteric bacteria belonging to the IncF and IncHI1 plasmid incompatibility groups, respectively. Based on sequence analysis, two genes of the F transfer region, traF and trbB, and three genes of the R27 transfer region, trhF, dsbC, and htdT, are predicted to encode periplasmic proteins containing a C-terminal thioredoxin fold. The C-X-X-C active-site motif of thioredoxins is present in all of these proteins except TraF(F). Escherichia coli carrying a dsbA mutation, which is deficient in disulfide bond formation, cannot synthesize pili and exhibits hypersensitivity to dithiothreitol (DTT) as monitored by mating ability. Overproduction of the E. coli disulfide bond isomerase DsbC, TrbB(F), DsbC(R27), or HtdT(R27), but not TraF(F) or TrhF(R27), reverses this hypersensitivity to DTT. Site-directed mutagenesis established that the C-X-X-C motif was necessary for this activity. Secretion into the periplasm of the C-terminal regions of TrbB(F) and DsbC(R27), containing putative thioredoxin folds, but not TrhF(R27), partially complemented the host dsbA mutation. A trbB(F) deletion mutant showed a 10-fold-lower mating efficiency in an E. coli dsbC null strain but had no phenotype in wild-type E. coli, suggesting redundancy in function between TrbB(F) and E. coli DsbC. Our results indicate that TrbB(F), DsbC(R27), and HtdT(R27) are putative disulfide bond isomerases for their respective transfer systems. TraF(F) is essential for conjugation but appears to have a function other than disulfide bond chemistry.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».