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Enregistrement W2044405928 · doi:10.1007/s10681-009-0030-5

A heritability-adjusted GGE biplot for test environment evaluation

2009· article· en· W2044405928 sur OpenAlexaff
Weikai Yan, James B. Holland

Notice bibliographique

RevueEuphytica · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic and phenotypic traits in livestock
Établissements canadiensAgriculture and Agri-Food Canada
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiplotHeritabilityContext (archaeology)Selection (genetic algorithm)MathematicsGene–environment interactionStatisticsBiologyComputer scienceGeneticsArtificial intelligenceGenotype

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Test environment evaluation has become an increasingly important issue in plant breeding. In the context of indirect selection, a test environment can be characterized by two parameters: the heritability in the test environment and its genetic correlation with the target environment. In the context of GGE biplot analysis, a test environment is similarly characterized by two parameters: its discrimination power and its similarity with other environments. This paper investigates the relationships between GGE biplots based on different data scaling methods and the theory of indirect selection, and introduces a heritability-adjusted (HA) GGE biplot. We demonstrate that the vector length of an environment in the HA-GGE biplot approximates the square root heritability ( $$ \sqrt H $$ ) within the environment and that the cosine of the angle between the vectors of two environments approximates the genetic correlation (r) between them. Moreover, projections of vectors of test environments onto that of a target environment approximate values of $$ r\sqrt H $$ , which are proportional to the predicted genetic gain expected in the target environment from indirect selection in the test environments at a constant selection intensity. Thus, the HA-GGE biplot graphically displays the relative utility of environments in terms of selection response. Therefore, the HA-GGE biplot is the preferred GGE biplot for test environment evaluation. It is also the appropriate GGE biplot for genotype evaluation because it weights information from the different environments proportional to their within-environment square root heritability. Approximation of the HA-GGE biplot by other types of GGE biplots was discussed.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,004
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,015
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Théorique ou conceptuel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes
Score de désaccord entre enseignants0,008
Score d'incertitude au seuil0,028

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0040,015
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0030,004
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0020,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0080,003

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,022
Tête enseignante GPT0,264
Écart entre enseignants0,242 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeThéorique ou conceptuel
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations239
Publié2009
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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