MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2044752351 · doi:10.1016/s0014-5793(03)00361-2

Glutamate substitutions at a PKA consensus site are consistent with inactivation of calpain by phosphorylation

2003· article· en· W2044752351 sur OpenAlexaff
Scott D. Smith, Zongchao Jia, Kassidy K. Huynh, Alan Wells, John S. Elce

Notice bibliographique

RevueFEBS Letters · 2003
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCalpain Protease Function and Regulation
Établissements canadiensQueen's University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCalpainPhosphorylationSerineThreonineAspartic acidEnzymeBiochemistryChemistryRecombinant DNAProtein subunitBiologyAmino acid

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Regulation of calpain by phosphorylation has often been suggested, but has proved difficult to detect. Calpains extracted from mammalian tissue are reported to contain 2-4 mol phosphate/mol of enzyme distributed over multiple sites, but phosphate groups are not detectable in the X-ray structures of recombinant calpain. Some serine and threonine residues in the large subunit of rat m-calpain were converted to aspartic or glutamic acid residues, at sites suggested by previous studies, to assess the probable effects of phosphate groups on the enzyme. Expression of the mutant calpains in Escherichia coli, and their heat stabilities, did not differ from those of the wild-type enzyme. m-Calpains with the mutations Ser50Asp, Ser50Glu, Ser67Glu, and Thr70Glu had the same specific activity and Ca(2+) requirement as the wild-type enzyme. In contrast, Ser369Asp-, Ser369Glu-, and Thr370Glu-m-calpain were inactive. This result is consistent with the recent report that phosphorylation at position 369 or 370 in vivo reduced m-calpain activation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,189
Écart entre enseignants0,183 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations41
Publié2003
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueFEBS LettersMême sujetCalpain Protease Function and RegulationTravaux en français237 207