Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator: the NBF1+R (nucleotide-binding fold 1 and regulatory domain) segment acting alone catalyses a Co2+/Mn2+/Mg2+-ATPase activity markedly inhibited by both Cd2+ and the transition-state analogue orthovanadate
Notice bibliographique
Résumé
Cystic fibrosis (CF) is caused by mutations in the gene encoding CFTR (cystic fibrosis transmembrane conductance regulator), a regulated anion channel and member of the ATP-binding-cassette transporter (ABC transporter) superfamily. Of CFTR's five domains, the first nucleotide-binding fold (NBF1) has been of greatest interest both because it is the major 'hotspot' for mutations that cause CF, and because it is connected to a unique regulatory domain (R). However, attempts have failed to obtain a catalytically active NBF1+R protein in the absence of a fusion partner. Here, we report that such a protein can be obtained following its overexpression in bacteria. The pure NBF1+R protein exhibits significant ATPase activity [catalytic-centre activity (turnover number) 6.7 min(-1)] and an apparent affinity for ATP ( K (m), 8.7 microM) higher than reported previously for CFTR or segments thereof. As predicted, the ATPase activity is inhibited by mutations in the Walker A motif. It is also inhibited by vanadate, a transition-state analogue. Surprisingly, however, the best divalent metal activator is Co(2+), followed by Mn(2+) and Mg(2+). In contrast, Ca(2+) is ineffective and Cd(2+) is a potent inhibitor. These novel studies, while demonstrating clearly that CFTR's NBF1+R segment can act independently as an active, vanadate-sensitive ATPase, also identify its unique cation activators and a new inhibitor, thus providing insight into the nature of its active site.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».