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Enregistrement W2044952902 · doi:10.1073/pnas.1312637110

KpsC and KpsS are retaining 3-deoxy- <scp>d</scp> - <i>manno</i> -oct-2-ulosonic acid (Kdo) transferases involved in synthesis of bacterial capsules

2013· article· en· W2044952902 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevueProceedings of the National Academy of Sciences · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineChemistry
ThématiqueCarbohydrate Chemistry and Synthesis
Établissements canadiensUniversity of Guelph
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésEscherichia coliCampylobacter jejuniPhosphatidylglycerolGlycosyltransferaseBiochemistryTransferaseComplementationHeptoseNeisseria meningitidisChemistryLinkerBiofilmGlycanMoietyBiologyBacteriaStereochemistryGlycoproteinEnzymeGenePhospholipid

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Capsular polysaccharides (CPSs) are high-molecular-mass cell-surface polysaccharides, that act as important virulence factors for many pathogenic bacteria. Several clinically important Gram-negative pathogens share similar systems for CPS biosynthesis and export; examples include Escherichia coli, Campylobacter jejuni, Haemophilus influenzae, Neisseria meningitidis, and Pasteurella multocida. Each CPS contains a serotype-specific repeat-unit structure, but the glycans all possess a lipid moiety at their reducing termini. In E. coli and N. meningitidis, the predominant lipid is a lysophosphatidylglycerol moiety that is attached to the repeat-unit domain of the CPS via multiple residues of 3-deoxy-D-manno-oct-2-ulosonic acid (Kdo), referred to as a poly-Kdo linker. The Kdo residues are β-linked, suggesting that they are synthesized by retaining glycosyltransferases. To date, the only characterized Kdo transferases are the inverting enzymes that catalyze the α-linkages found in lipopolysaccharide. Here, we identify two conserved proteins from CPS assembly systems, KpsC and KpsS, as the β-Kdo-transferases and demonstrate in vitro reconstitution of poly-Kdo linker assembly on a fluorescent phosphatidylglycerol acceptor. KpsS adds the first Kdo residue, and this reaction product is then extended by KpsC. Cross-complementation experiments demonstrate that the E. coli and N. meningitidis protein homologs are functionally conserved.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,008
Score d'incertitude au seuil0,587

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,001
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,029
Tête enseignante GPT0,242
Écart entre enseignants0,212 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle