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Enregistrement W2045062204 · doi:10.1126/science.1232685

Influence of HLA-C Expression Level on HIV Control

2013· article· en· W2045062204 sur OpenAlexaff
Richard Apps, Qi Ying, Jonathan M. Carlson, Haoyan Chen, Xiaojiang Gao, Rasmi Thomas, Yuko Yuki, Greg Q. Del Prete, Philip Goulder, Zabrina L. Brumme, Chanson J. Brumme, Mina John, S. Mallal, George W. Nelson, Ronald J. Bosch, David Heckerman, Judy L. Stein, Kelly A. Soderberg, M. Anthony Moody, Thomas N. Denny, Xue Zeng, Jing‐Yuan Fang, Ashley Moffett, Jeffrey D. Lifson, James J. Goedert, Susan Buchbinder, Gregory D. Kirk, Jacques Fellay, Paul J. McLaren, Steven G. Deeks, Florencia Pereyra, Bruce D. Walker, Nelson L. Michael, Amy Weintrob, Steven M. Wolinsky, Wilson Liao, Mary Carrington

Notice bibliographique

RevueScience · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueImmune Cell Function and Interaction
Établissements canadiensAIDS VancouverSimon Fraser University
Organismes subventionnairesNational Institute on Drug AbuseNational Institute of Mental HealthNational Heart, Lung, and Blood InstituteNational Health and Medical Research CouncilNational Institute of Arthritis and Musculoskeletal and Skin DiseasesNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesMedical Research CouncilCenter for AIDS Research, University of WashingtonNational Center for Research ResourcesChina Scholarship CouncilNational Cancer InstituteInternational AIDS SocietyBritish Heart FoundationWellcome TrustDeutsches KrebsforschungszentrumMassachusetts General HospitalBill and Melinda Gates FoundationNational Science FoundationNational Institutes of HealthU.S. Department of Health and Human ServicesSchweizerischer Nationalfonds zur Förderung der Wissenschaftlichen ForschungU.S. Department of Defense
Mots-clésHuman leukocyte antigenHLA-CCytotoxic T cellImmunologyHLA-B AntigensAlleleBiologyDiseaseGeneticsAntigenMedicineGeneInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

A variant upstream of human leukocyte antigen C (HLA-C) shows the most significant genome-wide effect on HIV control in European Americans and is also associated with the level of HLA-C expression. We characterized the differential cell surface expression levels of all common HLA-C allotypes and tested directly for effects of HLA-C expression on outcomes of HIV infection in 5243 individuals. Increasing HLA-C expression was associated with protection against multiple outcomes independently of individual HLA allelic effects in both African and European Americans, regardless of their distinct HLA-C frequencies and linkage relationships with HLA-B and HLA-A. Higher HLA-C expression was correlated with increased likelihood of cytotoxic T lymphocyte responses and frequency of viral escape mutation. In contrast, high HLA-C expression had a deleterious effect in Crohn's disease, suggesting a broader influence of HLA expression levels in human disease.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,235
Écart entre enseignants0,222 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations382
Publié2013
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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