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Enregistrement W2045131958 · doi:10.1096/fj.14-264499

Solution NMR and calorimetric analysis of Rem2 binding to the Ca <sup>2+</sup> channel β4 subunit: a low affinity interaction is required for inhibition of Cav2.1 Ca <sup>2+</sup> currents

2015· article· en· W2045131958 sur OpenAlexafffund
Xingfu Xu, Fang‐Xiong Zhang, Gerald W. Zamponi, William A. Horne

Notice bibliographique

RevueThe FASEB Journal · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueIon channel regulation and function
Établissements canadiensUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesNational Institute of Neurological Disorders and StrokeNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCanadian Institutes of Health ResearchAlberta Innovates - Health SolutionsNational Institutes of HealthNational Science Foundation
Mots-clésProtein subunitMutantBinding siteChemistryBiophysicsIntracellularAllosteric regulationWild typeBiochemistryBiologyReceptorGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT Rem, Rad, Kir/Gem (RGK) proteins, including Rem2, mediate profound inhibition of high‐voltage activated Ca 2+ channels containing intracellular regulatory β subunits. All RGK proteins bind to voltage‐gated Ca 2+ channel β subunit (Cavβ) subunits in vitro , but the necessity of the interaction for current inhibition remains controversial. This study applies NMR and calorimetric techniques to map the binding site for Rem2 on human Cavβ4a and measure its binding affinity. Our experiments revealed 2 binding surfaces on the β4 guanylate kinase domain contributing to a 156 ± 18 μM K d interaction: a hydrophobic pocket lined by 4 critical residues (L173, N261, H262, and V303), mutation of any of which completely disrupted binding, and a nearby surface containing 3 residues (D206, L209, and D258) that when individually mutated decreased affinity. Voltage‐gated Ca 2+ channel α1A subunit (Cav2.1) Ca 2+ currents were completely inhibited by Rem2 when co‐expressed with wild‐type Cavβ4a, but were unaffected by Rem2 when coexpressed with a Cavβ4a site 1 (L173A/V303A) or site 2 (D258A) mutant. These results provide direct evidence for a low‐affinity Rem2/Cavβ4 interaction and show definitively that the interaction is required for Cav2.1 inhibition.—Xu, X., Zhang, F., Zamponi, G. W., Horne, W. A. Solution NMR and calorimetric analysis of Rem2 binding to the Ca 2+ channel β4 subunit: a low affinity interaction is required for inhibition of Cav2.1 Ca 2+ currents. FASEB J. 29, 1794‐1804 (2015). www.fasebj.org

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: Simulation ou modélisation
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,052
Score d'incertitude au seuil0,470

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,047
Tête enseignante GPT0,290
Écart entre enseignants0,243 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations8
Publié2015
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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