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Enregistrement W2045271912 · doi:10.1182/blood-2014-01-548651

UBAP2L is a novel BMI1-interacting protein essential for hematopoietic stem cell activity

2014· article· en· W2045271912 sur OpenAlexafffund
Marie-Ève Bordeleau, Romain Aucagne, Jalila Chagraoui, Simon Girard, Nadine Mayotte, Éric Bonneil, Pierre Thibault, Caroline Pabst, Anne Bergeron, Frédéric Barabé, Josée Hébert, Martin Sauvageau, Christel Boutonnet, Sylvain Meloche, Guy Sauvageau

Notice bibliographique

RevueBlood · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEpigenetics and DNA Methylation
Établissements canadiensHôpital Maisonneuve-RosemontUniversité de MontréalUniversité LavalHôpital de l'Enfant-JésusCentre hospitalier universitaire de QuébecInstitute for Research in Immunology and Cancer
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésBMI1HaematopoiesisStem cellProgenitor cellBiologyGene knockdownCell biologyPolycomb-group proteinsHematopoietic stem cellCancer researchCell cultureGeneticsGeneRepressorGene expression

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Multipotent long-term repopulating hematopoietic stem cells (LT-HSCs) can self-renew or differentiate into the less primitive short-term repopulating stem cells (ST-HSCs), which themselves produce progenitors that ensure the daily supply of all essential blood components. The Polycomb group (PcG) protein BMI1 is essential for the activity of both HSCs and progenitor cells. Although BMI1 operates by suppressing the Ink4a/Arf locus in progenitors and ST-HSCs, the mechanisms through which this gene regulates the activity of LT-HSCs remain poorly understood. Toward this goal, we isolated BMI1-containing protein complexes and identified UBAP2L as a novel BMI1-interacting protein. We also showed that UBAP2L is preferentially expressed in mouse and human HSC-enriched populations when compared with more mature cell types, and that this gene is essential for the activity of LT-HSCs. In contrast to what is observed for Bmi1 knockdown, we found that UBAP2L depletion does not affect the Ink4a/Arf locus. Given that we demonstrated that BMI1 overexpression is able to rescue the deleterious effects of Ubap2l downregulation on LT-HSC activity and that UBAP2L is part of a PcG subcomplex comprising BMI1, we propose a model in which at least 2 different BMI1-containing PcG complexes regulate HSC activity, which are distinguishable by the presence of UBAP2L.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,249
Écart entre enseignants0,239 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations36
Publié2014
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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