Spliced Human Immunodeficiency Virus Type 1 RNA Is Reverse Transcribed into cDNA within Infected Cells
Notice bibliographique
Résumé
Both the full-length and spliced RNA species of HIV-1 possess the necessary cis-acting elements including the primer binding site (PBS), the polypurine tract (PPT), as well as the 5' R and 3' R regions that are needed for their conversion to double-stranded cDNA through reverse transcription. Since measurable amounts of spliced viral RNA molecules can be detected within virus particles, we have examined the potential for reverse transcription of such virion-associated spliced viral RNA upon infection of permissive cells. Analysis of viral cDNA species by PCR and DNA sequencing not only led to the identification of viral DNA molecules that were reverse transcribed from full-length viral RNA, but also DNA molecules that displayed the same nucleotide sequences as those found in spliced viral RNA, except that the former harbored the complete long terminal repeats (LTR), a feature that distinguishes proviral DNA from viral genomic RNA. Further studies revealed various types of cDNA species that resemble the spliced viral RNA encoding each of the env, tat, rev, or nef genes, of which the nef cDNA represents the majority. Therefore, spliced HIV-1 RNA molecules must have been reverse transcribed along with full-length viral RNA during infection.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,002 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».