Development of a DNA Macroarray for Detection and Monitoring of Economically Important Apple Diseases
Notice bibliographique
Résumé
Short DNA gene sequences (oligonucleotides) from the ribosomal spacer regions of bacterial and fungal pathogens were used to identify and monitor economically important apple diseases. The oligonucleotides or probes were attached to a nylon membrane by an amine modified linker arm and arranged in a precise pattern to form an array for detecting five pathogens corresponding to five apple diseases. Initially the specificity of the probes was determined by hybridizing pure cultures of the pathogens to the probes. The DNA array correctly identified Botrytis cinerea, Penicillium expansum, Podosphaera leucotricha, Venturia inaequalis, and Erwinia amylovora and eliminated closely related species. When the array was used to monitor V. inaequalis ascospores collected from spore traps located in orchards, it confirmed the presence of ascospores as predicted by the disease forecasting model. Preliminary tests to quantify P. leucotricha populations using grayscale values was effective to 20 conidia per leaf disk. The DNA array is a promising new detection system for accurate identification of several pathogens in a single test with the potential for being a new tool for epidemiological studies.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».