The Rtt106 Histone Chaperone Is Functionally Linked to Transcription Elongation and Is Involved in the Regulation of Spurious Transcription from Cryptic Promoters in Yeast*♦
Notice bibliographique
Résumé
Rtt106 is a histone chaperone that has been suggested to play a role in heterochromatin-mediated silencing in Saccharomyces cerevisiae. It interacts physically and functionally with the chromatin assembly factor-1 (CAF-1), which is associated with replication-coupled nucleosomal deposition. In this work, we have taken several approaches to study Rtt106 in greater detail and have identified a previously unknown function of Rtt106. We found genetic interactions between rtt106Delta and mutations in genes encoding transcription elongation factors, including Spt6, TFIIS, and members of the PAF and yeast DSIF complexes. In addition, chromatin immunoprecipitation analysis indicates that Rtt106 is associated with transcribed regions of active genes. Furthermore, our results show that Rtt106 is required for the repression of transcription from a cryptic promoter within a coding region. This observation strongly suggests that Rtt106 is involved in the regulation of chromatin structure of transcribed regions. Finally, we provide evidence that Rtt106 plays a role in regulating the levels of histone H3 transcription-coupled deposition over transcribed regions. Taken together, our results indicate a direct link for Rtt106 with transcription elongation and the chromatin dynamics associated with RNA polymerase II passage.
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Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».