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Enregistrement W2046710093 · doi:10.1577/h05-043.1

Differential Gene Expression in Atlantic Salmon Infected with <i>Lepeophtheirus salmonis</i>

2006· article· en· W2046710093 sur OpenAlexafffund
Mark D. Fast, Neil W. Ross, Denise M. Muise, Stewart C. Johnson

Notice bibliographique

RevueJournal of Aquatic Animal Health · 2006
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueAquaculture disease management and microbiota
Établissements canadiensIntertek (Canada)Institute for Marine BiosciencesDalhousie University
Organismes subventionnairesNational Research Council CanadaNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésLepeophtheirusBiologyDifferential (mechanical device)GeneFisheryGene expressionZoologyFish <Actinopterygii>GeneticsAquaculture

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Lepeophtheirus salmonis is an ectoparasitic copepod that can cause serious disease outbreaks in salmonids. Previous work has shown that Atlantic salmon Salmo salar show very little, if any, tissue response to infection, whereas less-susceptible host species exhibit strong inflammatory responses. The objective of this study was to examine whether a low-level L. salmonis infection in the absence of a stress response would have an effect on expression of Atlantic salmon immune-related genes over time. The effects of low-level infection (approximately 8–11 lice/fish) on kidney tissue and head kidney leukocyte immune-related gene expression were studied at two postinfection time points. At this level of infection, there was no evidence of a cortisol stress response. By use of real-time polymerase chain reaction, constitutive expression of the major histocompatibility (MH) class I gene was shown to be 2–10-fold lower in infected Atlantic salmon head kidneys by 21 d postinfection (dpi) than in head kidneys of uninfected fish held under the same conditions. Conversely, by 14 and 21 dpi, constitutive MH class II expression was significantly increased (&amp;gt;10-fold) in infected fish. Constitutive expression of interleukin (IL) 1β also increased threefold in head kidneys of infected fish by 21 dpi; however, no differences were observed in cyclooxygenase (COX)-2 expression over the course of the infection. Adherent head kidney leukocytes from control Atlantic salmon showed an increase in MH class I and COX-2 expression after 3 h of lipopolysaccharide (LPS) stimulation for all three time points collected. The use of LPS stimulation on similar leukocytes from infected fish did not further increase levels of MH class I and COX-2 expression. This is the first report on host gene expression during an ectoparasitic copepod infection. The implications of these expression changes will be discussed with respect to the host–parasite relationship.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,811
Score d'incertitude au seuil0,598

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,235
Écart entre enseignants0,227 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations46
Publié2006
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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