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Enregistrement W2046958302 · doi:10.4161/epi.28864

SETD6 controls the expression of estrogen-responsive genes and proliferation of breast carcinoma cells

2014· article· en· W2046958302 sur OpenAlexafffund
Daniel O’Neill, Stuart C. Williamson, Dhuha Alkharaif, Isabella Christina Mazzaro Monteiro, Marilyn Goudreault, Luke Gaughan, Craig Robson, Anne‐Claude Gingras, Olivier Binda

Notice bibliographique

RevueEpigenetics · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEpigenetics and DNA Methylation
Établissements canadiensUniversity of TorontoLunenfeld-Tanenbaum Research Institute
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchWellcome Trust
Mots-clésBiologyCancer researchNuclear receptorEstrogen receptorNuclear receptor co-repressor 1Cell biologyTranscription factorMolecular biologyGeneticsGeneCancer

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The lysine methyltransferase SETD6 modifies the histone variant H2AZ, a key component of nuclear receptor-dependent transcription. Herein, we report the identification of several factors that associate with SETD6 and are implicated in nuclear hormone receptor signaling. Specifically, SETD6 associates with the estrogen receptor α (ERα), histone deacetylase HDAC1, metastasis protein MTA2, and the transcriptional co-activator TRRAP. Luciferase reporter assays identify SETD6 as a transcriptional repressor, in agreement with its association with HDAC1 and MTA2. However, SETD6 behaves as a co-activator of several estrogen-responsive genes, such as PGR and TFF1. Consistent with these results, silencing of SETD6 in several breast carcinoma cell lines induced cellular proliferation defects accompanied by enhanced expression of the cell cycle inhibitor CDKN1A and induction of apoptosis. Herein, we have identified several chromatin proteins that associate with SETD6 and described SETD6 as an essential factor for nuclear receptor signaling and cellular proliferation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,224
Écart entre enseignants0,218 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations43
Publié2014
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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