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Enregistrement W2047153354 · doi:10.1002/jmr.1086

Rhodopsin is spatially heterogeneously distributed in rod outer segment disk membranes

2011· article· en· W2047153354 sur OpenAlexafffund
Nikolay Buzhynskyy, Christian Salesse, Simon Scheuring

Notice bibliographique

RevueJournal of Molecular Recognition · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueReceptor Mechanisms and Signaling
Établissements canadiensUniversité Laval
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésRhodopsinPeripherinBiophysicsMembraneTransducinLipid bilayerCrystallographyBiologyMembrane proteinChemistryRetinalBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The visual photoreception takes place in the retina, where specialized rod and cone photoreceptor cells are located. The rod outer segments contain a stack of 500-2,000 sealed membrane disks. Rhodopsin is the visual pigment located in rod outer segment disks, it is a member of the G-protein-coupled receptor (GPCR) superfamily, an important group of membrane proteins responsible for the majority of physiological responses to stimuli such as light, hormones, peptides, etc. Alongside rhodopsin, peripherin/Rom proteins located in the disk rims are thought to be responsible for disk morphology. Here we describe the supramolecular structure of rod outer segment disk membranes and the spatial organization of rhodopsin and peripherin/Rom molecules. Using atomic force microscopy operated in physiological buffer solution, we found that rhodopsin is loosely packed in the central region of the disks, in average about 26 000 molecules covering approximately one third of the disk surface. Peripherin/Rom proteins form dense assemblies in the rim region. A protein-free lipid bilayer girdle separates the rhodopsin and peripherin/Rom domains. The described supramolecular assembly of rhodospin, peripherin/Rom and lipids in native rod outer segment disks is consistent with the functional requirements of photoreception.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,024
Tête enseignante GPT0,233
Écart entre enseignants0,209 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations49
Publié2011
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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