Alteration ofAKAP220, an upstream component of the Rb pathway, in oral carcinogenesis
Notice bibliographique
Résumé
Few genes have been implicated in the development of oral cancer. In our study, we identified a novel gene in the Rb pathway that is frequently altered and overexpressed in oral tumors. Significantly, the alteration is also associated with early oral premalignant lesions (OPLs). This region was identified through a genomewide scan using randomly amplified polymorphic DNA (RAPD) PCR of 40 microdissected oral squamous cell carcinomas (SCCs). Recurrent gain of a approximately 400 bp signal was observed in multiple patients. This gain was localized to 13q14.11, a region frequently altered in multiple cancer types. Through microsatellite analysis, a 1.9 Mbp minimal region of alteration (MRA) was defined between D13S263 and D13S1227. Allelic imbalance (AI) in the MRA was present in only 28% of low-grade dysplasia, but strikingly increased with progression to 64% in high-grade dysplasia, plateauing at 61% in tumors, thus implicating this alteration in the early stages of disease development. Of the 3 genes residing within the MRA, Receptor Activator of NK-kappa-B Ligand (RANKL) and Diacylglycerol Kinase (DGKH) showed no change in expression levels in tumors compared to normal tissue. In contrast, 12 of 16 tumors showed significant overexpression of A-Kinase Anchoring Protein 220 (AKAP220). Since AKAP220 plays a role in regulating the Rb pathway, its dysregulation may contribute significantly to alterations in cell cycle regulation that facilitate progression of OPLs.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».