The Tryptophan-Rich Region of HIV gp41 and the Promotion of Cholesterol-Rich Domains
Notice bibliographique
Résumé
The peptide N-acetyl-KWASLWNWFNITNWLWYIK-amide has a sequence that corresponds to the juxtamembrane region of the HIV-1 gp41 fusion protein. We have studied how cholesterol modulates the interaction of this peptide with membranes containing cholesterol using differential scanning calorimetry, circular dichroism, fluorescence spectroscopy, and nuclear magnetic resonance. We find that this peptide is less able to sequester cholesterol into domains than is N-acetyl-LWYIK-amide. On the other hand, the peptide N-acetyl-LASWIK-amide, which corresponds to a segment of HIV-2 and SIV gp41 fusion proteins, has intermediate potency between N-acetyl-KWASLWNWFNITNWLWYIK-amide and N-acetyl-LWYIK-amide in forming areas enriched in cholesterol, even though it does not have a cholesterol recognition/interaction amino acid consensus sequence (CRAC). We suggest that the difference between HIV-1 and HIV-2 in their requirements for glycosphingolipids in determining their tropism is related to their difference in partitioning to cholesterol-rich domains in biological membranes.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».