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Enregistrement W2047734512 · doi:10.1021/bi035432b

Metal Ion Binding Properties and Conformational States of Calcium- and Integrin-Binding Protein

2004· article· en· W2047734512 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueBiochemistry · 2004
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueSignaling Pathways in Disease
Établissements canadiensUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésChemistryBiophysicsConformational changeCalciumProtein structureCalcium-binding proteinCalmodulinBinding siteIntegrinBinding domainEF handProtein secondary structureBiochemistryPlasma protein bindingReceptorBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Calcium- and integrin-binding protein (CIB) is a novel member of the helix-loop-helix family of regulatory calcium-binding proteins which likely has a specific function in hemostasis through its interaction with platelet integrin alphaIIbbeta(3). The significant amino acid sequence homology between CIB and other regulatory calcium-binding proteins such as calmodulin, calcineurin B, and recoverin suggests that CIB may undergo a calcium-induced conformational change; however, the mechanism of calcium binding and the details of a structural change have not yet been investigated. Consequently, we have performed a variety of spectroscopic and microcalorimetric studies of CIB to determine its calcium binding characteristics, and the subsequent conformational changes that occur. Furthermore, we provide the first evidence for magnesium binding to CIB and determine the structural consequences of this interaction. Our results indicate that in the absence of any bound metal ions, apo-CIB adopts a folded yet highly flexible molten globule-like structure. Both calcium and magnesium binding induce conformational changes which stabilize both the secondary and tertiary structure of CIB, resulting in considerable increases in the thermal stability of the proteins. CIB was found to bind two Ca(2+) ions in a sequential manner with dissociation constants (K(d)) near 0.54 and 1.9 microM for sites EF-4 and EF-3, respectively. In contrast, CIB bound only one Mg(2+) ion to EF-3 with a K(d) near 120 microM. Together, our results suggest that CIB may exist in multiple structural and metal ion-bound states in vivo which may play a role in its regulation of target proteins such as platelet integrin.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,445

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,022
Tête enseignante GPT0,238
Écart entre enseignants0,215 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle