Abstract 5049: Functional significance of <i>L1CAM</i> in non-small cell lung cancer
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Background: Non-small cell lung cancer (NSCLC) accounts for 80% of all lung cancers. Early stage NSCLC patients are treated by complete surgical resection, but the 5-year survival rate remains relatively poor at 50%. Deaths are mainly due to metastatic recurrence. Post-surgery (adjuvant) chemotherapy may significantly improve survival, but improved selection methods for patients who are most likely to benefit from the adjuvant treatment are required. Our laboratory has recently identified a 15-gene expression signature capable of classifying patients based on risk of death and at the same time predicting benefits of adjuvant chemotherapy in high-risk patients (J Clin Oncol 26: 2008, May 20 suppl; abstr 7510). We hypothesize that genes whose expression are de-regulated significantly in patients with a poor prognosis may play important roles in tumorigenesis and metastasis. Our goal is to functionally characterize the roles of these prognostic genes in the growth and metastatic potential of NSCLC. One of these signature genes is L1CAM, a cell adhesion molecule. Although extensively characterized in the nervous system, the role of L1CAM in NSCLC has not been defined. Methods: We stably modified the expression of L1CAM at both the RNA and protein levels in NSCLC cell lines using the lentiviral cDNA/shRNA system. In vitro matrigel assays were used to assess invasion and cell migration by wound-healing assays. Results: Downregulation of L1CAM expression resulted in decreased invasiveness and motility of metastatic NSCLC cell lines. In contrast, loss of L1CAM did not alter the growth rate on plastic. Studies on anchorage-independent growth and in vivo tumorigenicity and metastatic potential are ongoing and the results will be presented. Conclusion: Considering the importance of migratory phenotype in the first steps of metastasis, the results suggest that L1CAM contributes to malignancy in NSCLC and may be a novel therapeutic gene for this disease. (Supported by Canadian Cancer Society Research Institute grant #020527) Citation Format: {Authors}. {Abstract title} [abstract]. In: Proceedings of the 101st Annual Meeting of the American Association for Cancer Research; 2010 Apr 17-21; Washington, DC. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2010;70(8 Suppl):Abstract nr 5049.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».