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Enregistrement W2048088501 · doi:10.1371/journal.ppat.1002840

CD160 and PD-1 Co-Expression on HIV-Specific CD8 T Cells Defines a Subset with Advanced Dysfunction

2012· article· en· W2048088501 sur OpenAlexafffund
Yoav Peretz, Zhong He, Yu Shi, Bader Yassine‐Diab, Jean-Philippe Goulet, Rebeka Bordi, Ali Filali‐Mouhim, Jean-Baptiste Loubert, Mohamed El‐Far, Franck P. Dupuy, Mohamed Rachid Boulassel, Cécile Tremblay, Jean‐Pierre Routy, Nicole F. Bernard, Robert Balderas, Elias K. Haddad, Rafick‐Pierre Sékaly

Notice bibliographique

RevuePLoS Pathogens · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueImmune Cell Function and Interaction
Établissements canadiensMcGill UniversityRoyal Victoria HospitalMcGill University Health CentreRoyal Victoria Regional Health CentreUniversité de MontréalCaprion (Canada)
Organismes subventionnairesNational Institutes of HealthNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesCanadian Institutes of Health ResearchCanadian Foundation for AIDS ResearchStyrelsen för Internationellt Utvecklingssamarbete
Mots-clésCytotoxic T cellCD8Downregulation and upregulationT cellBiologyCell biologyImmunologyJurkat cellsChemistryImmune systemIn vitroBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Chronic viral infections lead to persistent CD8 T cell activation and functional exhaustion. Expression of programmed cell death-1 (PD-1) has been associated to CD8 T cell dysfunction in HIV infection. Herein we report that another negative regulator of T cell activation, CD160, was also upregulated on HIV-specific CD8 T lymphocytes mostly during the chronic phase of infection. CD8 T cells that expressed CD160 or PD-1 were still functional whereas co-expression of CD160 and PD-1 on CD8 T cells defined a novel subset with all the characteristics of functionally exhausted T cells. Blocking the interaction of CD160 with HVEM, its natural ligand, increased HIV-specific CD8 T cell proliferation and cytokine production. Transcriptional profiling showed that CD160(-)PD-1(+)CD8 T cells encompassed a subset of CD8(+) T cells with activated transcriptional programs, while CD160(+)PD-1(+) T cells encompassed primarily CD8(+) T cells with an exhausted phenotype. The transcriptional profile of CD160(+)PD-1(+) T cells showed the downregulation of the NFκB transcriptional node and the upregulation of several inhibitors of T cell survival and function. Overall, we show that CD160 and PD-1 expressing subsets allow differentiating between activated and exhausted CD8 T cells further reinforcing the notion that restoration of function will require multipronged approaches that target several negative regulators.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,178
Score d'incertitude au seuil0,999

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,003

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,212
Écart entre enseignants0,196 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; les deux têtes enseignantes s’accordent sur ce qui est montré ici.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations143
Publié2012
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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