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Enregistrement W2048955552 · doi:10.1080/07060660109506913

Vegetative compatibility among<i>Fusarium graminearum</i>(<i>Gibberella zeae</i>) isolates from barley spikes in southern Manitoba<sup>1</sup>

2001· article· en· W2048955552 sur OpenAlexaffvenueabout
Brent McCallum, A. Tekauz, J. Gilbert

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Plant Pathology · 2001
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueMycotoxins in Agriculture and Food
Établissements canadiensAgriculture and Agri-Food Canada
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésGibberella zeaeBiologyFusariumGibberellaPopulationGibberella fujikuroiBotanyHorticulture

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Vegetative compatibility groups (VCGs) were determined for 43 Fusarium graminearum Schwabe (Gibberella zeae (Schwein.) Petch) isolates from barley using nitrate-nonutilizing mutants. Single isolates from 22 fields throughout southern Manitoba were used to evaluate regional diversity, and an additional 21 isolates from 10 spikes in 4 fields were used to estimate local diversity. Of 183 mutants generated, 67 utilized both nitrite and hypoxanthine (nit1), 89 utilized hypoxanthine but not nitrite (nit3), and 27 utilized nitrite but not hypoxanthine (NitM). A nit1 mutant from each isolate was paired on nitrate medium to either a nit3 or NitM mutant from all isolates. There were 21 VCGs among 22 isolates collected throughout Manitoba and 16 VCGs among 21 isolates used to estimate local diversity. When the 43 isolates were combined, 34 VCGs were identified. The average ratio of VCGs to isolates was 0.95 for isolates from different fields, 0.94 for isolates from different spikes within a field, and 0.90 for isolates within the same spike. The results indicate a high degree of VCG diversity in the F. graminearum population from barley spikes at the regional, local, and within-spike levels. This diversity should be considered when screening barley germplasm for fusarium head blight resistance. Les groupes de compatibilité végétative (GCV) furent déterminés chez 43 isolats du Fusarium graminearum Schwabe (Gibberella zeae (Schwein.) Petch) sur l'orge en se servant de mutants incapables d'utiliser le nitrate. Des isolats, un pour chacun de 22 champs dispersés dans tout le sud du Manitoba, furent utilisés pour évaluer la diversité régionale, et 21 autres isolats obtenus de 10 épis dans 4 champs furent utilisés pour évaluer la diversité locale. Des 183 mutants générés, 67 utilisaient à la fois les nitrites et l'hypoxanthine (nit1), 89 utilisaient l'hypoxanthine mais pas les nitrites (nit3) et 27 utilisaient les nitrites mais pas l'hypoxanthine (NitM). Sur un milieu au nitrate, un mutant nit1 de chaque isolat fut confronté à un mutant nit3 ou NitM de chacun des autres isolats. Il y avait 21 GCV parmi les 22 isolats échantillonnés à travers le Manitoba et 16 GCV parmi les 21 isolats qui ont servi à estimer la diversité locale. Lorsque les 43 isolats furent confrontés, 34 GCV furent identifiés. Le rapport moyen entre le nombre de VGC et le nombre d'isolats était de 0,95 pour les isolats des différents champs, de 0,94 pour les isolats des différents épis dans un champ donné et de 0,90 pour les isolats obtenus d'un même épi. Les résultats indiquent une diversité de GCV très élevée dans la population du F. graminearum des épis d'orge aux niveaux régional, local et de l'épi. Cette diversité devrait être prise en compte lors de la sélection génétique dans les germoplasmes pour la résistance à la brÛlure des épis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,908
Score d'incertitude au seuil0,182

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,183
Écart entre enseignants0,169 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations29
Publié2001
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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