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Enregistrement W2049044463 · doi:10.1158/1538-7445.am2014-lb-90

Abstract LB-90: Molecular mechanism of TAZ-induced lung tumorigenesis

2014· article· en· W2049044463 sur OpenAlexaff
Adel B Alharbi, Hongchao Shan, Yawei Hao, Xiaolong Yang

Notice bibliographique

RevueCancer Research · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueHippo pathway signaling and YAP/TAZ
Établissements canadiensQueen's University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCarcinogenesisHippo signaling pathwayBiologyCancer researchActivator (genetics)Cell cultureCell growthCell biologyNude mouseCellNeoplastic transformationGeneMolecular biologySignal transductionGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract The transcriptional co-activator with PDZ-binding domain (TAZ) is a transcriptional co-activator and major component of an emerging signaling pathway called the Hippo pathway that plays critical roles in tumorigenesis, organ size control, stem cell renewal, drug resistance, etc. Recently, we have provided the first biological evidence that TAZ is over-expressed in non-small cell lung cancer (NSCLC) cells and over-expression of TAZ can transform HBE135 immortalized non-tumorigenic human lung epithelial cells (Zhou et al., 2011). However, the cellular genes mediating TAZ-induced transformation are unknown. In addition, there is no in vivo mouse model established to study the roles of TAZ in lung tumorigenesis in vivo. To address these issues, we have carried out the following experiments: First, a Dox-inducible lentiviral expression system was used to overexpress constitutively active TAZ (TAZ-S89A) in a mouse immortalized lung epithelial cell line (E10). Overexpression of TAZ-S89A in E10 cells caused increased cell proliferation, transformation, and tumor formation in vivo in nude mice. Next, tumorigenic stable cell lines (TAZS89A-TM) were established after isolating TAZS89A-induced tumors from mice. Second, to identify the downstream genes mediating TAZ-induced tumor formation, the technology of Next-generation sequencing (RNA-seq) was performed on the new tumorigenic cell line E10-TAZ-TM to identify downstream genes transcriptionally regulated by TAZ after induction of TAZ by Dox. By analyzing the data and confirming them using qRT-PCR, multiple significant oncogenes were found activated by TAZ overexpression. Third, these genes were knocked down by shRNAs in the tumorigenic E10-TAZS89A-TM cell line and tested whether they are important in TAZ-induced cell proliferation, transformation and tumor formation in mice. Finally, since previous studies indicate that TAZ is involved in mammary cell growth by interacting with transcription factor TEAD or through its WW domain, we also tested whether these genes are activated through TEAD-binding domain or WW-domain of TAZ. E10 stable cell lines overexpressing inducible TAZ mutant with amino acid mutations in TEAD-binding domain (TAZ-F52A/F53A) or WW domain (TAZ-W152A/P155A) were established, followed by qRT-PCR analysis. The TEAD-binding domain of TAZ was found necessary for activation of the identified genes and maintaining TAZ-induced oncogenic effects in lung cells. In conclusion, this project established the first in vivo xenograft mouse model system using TAZ-overexpressing lung epithelial cells, and identified the downstream target genes mediating TAZ-induced lung tumorigenesis. Citation Format: Adel B. Alharbi, Hongchao Shan, Yawei Hao, Xiaolong Yang. Molecular mechanism of TAZ-induced lung tumorigenesis. [abstract]. In: Proceedings of the 105th Annual Meeting of the American Association for Cancer Research; 2014 Apr 5-9; San Diego, CA. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2014;74(19 Suppl):Abstract nr LB-90. doi:10.1158/1538-7445.AM2014-LB-90

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,009

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,044
Tête enseignante GPT0,369
Écart entre enseignants0,325 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2014
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