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Enregistrement W2049264140 · doi:10.1094/pdis.2000.84.11.1241

Molecular Characterization of Vegetative Compatibility Group 4A and 4B Isolates of <i>Verticillium dahliae</i> Associated with Potato Early Dying

2000· article· en· W2049264140 sur OpenAlexaffabout
Katherine F. Dobinson, Myrtle Harrington, M. A. Omer, R. C. Rowe

Notice bibliographique

RevuePlant Disease · 2000
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueNematode management and characterization studies
Établissements canadiensWestern UniversityAgriculture and Agri-Food Canada
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésVerticillium dahliaeBiologyRestriction fragment length polymorphismSubspeciesVirulenceSolanaceaeLeafhopperNematodeFungi imperfectiIndustrial cropBotanyPolymerase chain reactionGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Forty isolates of Verticillium dahliae, collected from potato seed tubers and potato plants from various regions in North America and previously assigned to vegetative compatibility groups (VCGs) 4A or 4B, were characterized using molecular markers. The VCG 4A isolates were previously shown to be a highly virulent pathotype of potato and to interact synergistically with the root-lesion nematode Pratylenchus penetrans to cause potato early dying. All but one of the VCG 4A isolates characterized in this study lacked the subspecies-specific repetitive DNA sequence E18 and could be differentiated from the remaining isolates by restriction fragment length polymorphisms (RFLPs) in the nuclear rDNA and Trp1 loci. The E18 RFLP patterns of several VCG 4B isolates from Maine and New York were highly similar to those of VCG 4B isolates previously collected from potato and tomato fields in Ontario. The data presented here suggest that the molecular markers will be useful for the detection and classification of isolates of V. dahliae associated with potato early dying.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,182
Écart entre enseignants0,172 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations50
Publié2000
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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