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Enregistrement W2049273083 · doi:10.1039/b822794b

Phosphomannose isomerase/GDP-mannose pyrophosphorylase from Pyrococcus furiosus: a thermostable biocatalyst for the synthesis of guanidinediphosphate-activated and mannose-containing sugar nucleotides

2009· article· en· W2049273083 sur OpenAlexfundno aff
Nicola L. B. Pohl

Notice bibliographique

RevueOrganic & Biomolecular Chemistry · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineChemistry
ThématiqueCarbohydrate Chemistry and Synthesis
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesHerman Frasch Foundation for Chemical ResearchCanadian Association for the Study of the LiverNational Science Foundation
Mots-clésPyrococcus furiosusChemistryMannoseBiocatalysisBiochemistrySugarNucleotideHyperthermophileIsomeraseThermostabilityEnzymeGeneCatalysisReaction mechanism

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Herein we present an analysis of the chemical function of a recombinant bifunctional phosphomannose isomerase/GDP-mannose pyrophosphorylase (manC) from Pyrococcus furiosus DSM 3638 and its use in the synthesis of guanidinediphospho-hexoses and a range of nucleotidediphospho-mannoses. This enzyme is unusually promiscuous in both its nucleotide triphosphate (NTP) and sugar-1-phosphate acceptance. It accepts all five naturally occurring NTPs (ATP, CTP, GTP, dTTP and UTP) and a range of sugar-1-phosphates (glucose-, mannose-, galactose-, glucosamine-, N-acetylglucosamine- and fucose-1-phosphate). A truncated GDP-mannose pyrophosphorylase domain of the whole length enzyme showed almost 100-fold less sugar nucleotidyltransferase activity with only GTP and mannose 1-phosphate as substrates. The temperature stability and inherently broad substrate tolerance of this archaeal enzyme make it an effective reagent for the rapid chemoenzymatic synthesis of a range of natural and unnatural sugar nucleotides that are challenging to make by chemical means alone.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,011
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,208
Écart entre enseignants0,201 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations33
Publié2009
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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