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Enregistrement W2049573711 · doi:10.1111/j.1574-695x.2009.00645.x

Autoactivation of the AggR regulator of enteroaggregative<i>Escherichia coli in vitro</i>and<i>in vivo</i>

2009· article· en· W2049573711 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevueFEMS Immunology & Medical Microbiology · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEscherichia coli research studies
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchCrohn's and Colitis Foundation of CanadaCrohn's and Colitis Foundation
Mots-clésEnteroaggregative Escherichia coliBiologyFimbriaDNA footprintingRegulatorPrimer extensionVirulenceMicrobiologyEscherichia coliPlasmidResponse regulatorTranscriptional regulationLuciferaseMolecular biologyPromoterGeneticsGeneEnterobacteriaceaeGene expressionNucleotideTransfectionMutant

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Enteroaggregative Escherichia coli (EAEC) causes diarrhea in diverse populations worldwide. The AraC-like regulator AggR is a key virulence regulator in EAEC. AggR-regulated genes include those encoding the Aggregative Adherence Fimbria, the dispersin protein, and a type VI secretion system. This study characterizes the regulation of the aggR promoter (P(aggR)). Using primer extension analysis, the transcriptional start site of the aggR promoter was located 40 nucleotides upstream of the translational start. P(aggR) was found to be autoregulated and DNA footprinting revealed the presence of two AggR-binding sites: one upstream of the transcriptional start site and one downstream. Additionally, P(aggR) was found to be positively regulated by the DNA-binding protein FIS and negatively regulated by the global regulator H-NS. To further understand this complex regulation scheme, a bacterial luciferase reporter system was used with a mouse model of EAEC colonization. This allowed for the in vivo measurement of P(aggR), P(fis), and P(hns) activity. EAEC present in the mouse intestine possessed relatively high levels of P(fis) and P(aggR) activity and a low level of P(hns) when compared with in vitro experiments. The data provide significant insights into the regulation cascade leading to aggR expression in the mammalian intestine during EAEC infection.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,096
Score d'incertitude au seuil0,523

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,240
Écart entre enseignants0,234 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle