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Enregistrement W2050262449 · doi:10.1042/bj20090228

The C-terminal domain of Mnk1a plays a dual role in tightly regulating its activity

2009· article· en· W2050262449 sur OpenAlexafffund
Susan Goto, Zhong Yao, Christopher G. Proud

Notice bibliographique

RevueBiochemical Journal · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueProtein Kinase Regulation and GTPase Signaling
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchWeizmann Institute of Science
Mots-clésKinaseMAPK/ERK pathwayPhosphorylationAlternative splicingCell biologyRNA splicingC-terminusBiologyGene isoformPhosphorylation cascadeProtein kinase AEnzyme activatorSignal transductionBiochemistryGeneProtein phosphorylationAmino acidRNA

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The human family of MAPK (mitogen-activated protein kinase) signal-integrating kinases (Mnks) comprises four related proteins derived from two genes by alternative splicing. The MNK1 gene gives rise to two proteins, Mnk1a and Mnk1b, which possess distinct C-termini and properties. Despite lacking the C-terminal MAPK-binding site, Mnk1b shows higher basal activity than Mnk1a. In contrast, the activity of Mnk1a is tightly regulated by signalling through ERK (extracellular-signal-regulated kinase) and p38 MAPK. We show that the short C-terminus of Mnk1b confers on it a 'default' behaviour of substantial, but unregulated, activity. In contrast, the longer C-terminus of Mnk1a represses the basal activity and T (activation)-loop phosphorylation of this isoenzyme while allowing both properties to be stimulated by upstream MAPK signalling. Two features of the C-terminus of Mnk1a appear to account for this behaviour: the known MAPK-binding site and a region (predicted to be alpha-helical) which occludes access to the catalytic domain and the T-loop. The activation of Mnk1a results in a marked conformational change leading to a more 'open' structure. We also identified a conserved phenylalanine residue in an Mnk-specific insert as playing a key role in governing the ease with which Mnk1a can be phosphorylated. These studies help to identify the features that give rise to the diverse properties of human Mnk isoforms.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,007
Score d'incertitude au seuil0,367

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,252
Écart entre enseignants0,243 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations24
Publié2009
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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