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Enregistrement W2050554833 · doi:10.1038/nbt.1411

Promoting coherent minimum reporting guidelines for biological and biomedical investigations: the MIBBI project

2008· article· en· W2050554833 sur OpenAlexaff
Chris Taylor, Dawn Field, Susanna‐Assunta Sansone, Jan Aerts, Rolf Apweiler, Michael Ashburner, Catherine A. Ball, Pierre‐Alain Binz, Molly A. Bogue, Tim Booth, Alvis Brāzma, Ryan R. Brinkman, Adam M. Clark, Eric W. Deutsch, Oliver Fiehn, Jennifer Fostel, Peter Ghazal, F. Gibson, Tanya Gray, Graeme R. Grimes, John M. Hancock, Nigel Hardy, Henning Hermjakob, Randall K. Julian, Matthew D. Kane, Carsten Kettner, Christopher R. Kinsinger, Eugene Kolker, Martin Kuiper, Nicolas Le Novère, Jim Leebens‐Mack, Suzanna Lewis, Phillip Lord, Ann‐Marie Mallon, Nishanth Marthandan, Hiroshi Masuya, Ruth McNally, Alexander Mehrle, Norman Morrison, Sandra Orchard, John Quackenbush, James M. Reecy, Donald G. Robertson, Philippe Rocca‐Serra, Henry Rodriguez, Heiko Rosenfelder, Javier Santoyo‐López, Richard H. Scheuermann, Daniel Schober, Barry Smith, Jason Snape, Christian J. Stoeckert, Keith F. Tipton, Peter Sterk, Andreas Untergasser, Jo Vandesompele, Stefan Wiemann

Notice bibliographique

RevueNature Biotechnology · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBiomedical Text Mining and Ontologies
Établissements canadiensBC Cancer Agency
Organismes subventionnairesNatural Environment Research CouncilNational Institute of Biomedical Imaging and BioengineeringNational Human Genome Research InstituteBiotechnology and Biological Sciences Research Council
Mots-clésExtant taxonResource (disambiguation)Knowledge managementBusinessManagement scienceData scienceComputer scienceBiologyEngineeringEvolutionary biology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The Minimum Information for Biological and Biomedical Investigations (MIBBI) project aims to foster the coordinated development of minimum-information checklists and provide a resource for those exploring the range of extant checklists.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,615
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,666
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche
Catégories consensuellesMétarecherche
DomaineSignal candidat: Présentation des résultats · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes
Score de désaccord entre enseignants0,385
Score d'incertitude au seuil0,475

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,6150,666
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,003
Méta-épidémiologie (sens large)0,0030,003
Bibliométrie0,0250,021
Études des sciences et des technologies0,0090,008
Communication savante0,0190,022
Science ouverte0,0150,024
Intégrité de la recherche0,0100,017
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,105
Tête enseignante GPT0,371
Écart entre enseignants0,266 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; l’étiquette directe de Gemma et le classifieur distillé Codex s’accordent sur ce qui est montré ici.

Devis d'étudeSans objet
DomainePrésentation des résultats
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations562
Publié2008
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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