Mass Spectrometry Following Mild Enzymatic Digestion Reveals Phosphorylation of Recombinant Proteins in <i>Escherichia coli</i> Through Mechanisms Involving Direct Nucleotide Binding
Pourquoi ce travail est dans la base
Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.
Notice bibliographique
Résumé
A straightforward method using mild enzymatic digestions combined with MALDI mass spectrometry (MS) was used to enhance determination of the multiple phosphorylation sites of a set of recombinant nucleotide-binding proteins in Escherichia coli, including kinases and cystathionine beta-synthase (CBS) domain containing proteins. The protein kinases reveal abundant phosphorylations in the kinase domains and relatively low phosphogluconoylation (258 Da) at the N-terminal His-tag. In contrast, the CBS domain-containing proteins possess a highly conserved phosphorylation in vivo at Ser-2 of the His-tag. Multistage MS/MS and selected reaction monitoring established that the CBS domain proteins also contain a combined modification of gluconoylation (178 Da) and phosphorylation (80 Da) at two different sites, instead of an isobaric phosphogluconoylation (258 Da) event at the N-terminus. Functional analysis of 20 recombinant proteins as identified by mass spectrometry has shown the phosphorylation at the N-terminal His-tag is relevant to nucleotide binding and phosphotransfer reaction catalyzed by a serine protein kinase.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,009 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle