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Quantification of plasma lipids and apolipoproteins by use of proton NMR spectroscopy, multivariate and neural network analysis

2000· article· en· W2050599648 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueNMR in Biomedicine · 2000
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMetabolomics and Mass Spectrometry Studies
Établissements canadiensQueen's University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMultivariate statisticsNuclear magnetic resonance spectroscopySpectroscopyMultivariate analysisProtonChemistryPlasmaNuclear magnetic resonanceInternal medicineComputer sciencePhysicsStereochemistryMedicineMachine learningNuclear physics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

New approaches for quantification of human blood plasma lipids and apolipoproteins are presented. One method is based on multivariate analysis of proton nuclear magnetic resonance spectra of human blood plasma. Although similar approaches have been developed previously, this is the first time principal component analysis (PCA) and partial least squares regression (PLS) have been applied to this particular task. Further, a large proportion of the subjects in this study were cancer patients undergoing treatment, which introduced a new dimension to the quantification of lipoprotein distributions. Calibration models for prediction of lipids and apolipoproteins were constructed by use of PLS, and blind samples were used to test the predictive ability. Comparison of the predicted vs observed data obtained by standard clinical chemical procedures gave good agreement; the correlation coefficient for total plasma triglyceride was 0.99, for total plasma cholesterol 0.98, for LDL cholesterol 0.97, and for HDL cholesterol 0.88. These results are comparable with those obtained with other methods. The quantitative analysis of 14 components (including total cholesterol and total triglyceride) of human blood plasma was also undertaken using various neural network (NN) analyses of selected portions of the spectra. Conventional fully connected backpropagation neural network topologies were capable of providing excellent predictions for the majority of the variables, confirming and reinforcing literature related to this approach. However HDL triglycerides were poorly predicted, while intermediate-quality results were obtained for the LDL cholesterol, plasma apoA1 and LDL apoB variables. In these instances, applying significantly different neural network algorithms involving either general regression or polynomial neural networks in combination with genetic adaptive components for parameter optimisation made improved predictions. Copyright © 2000 John Wiley & Sons, Ltd. Abbreviations used: ApoA1 apolipoprotein A1 ApoB apolipoprotein B FID free induction decay GMDH group method of data handling GRNN general regression neural network HDL high density lipoprotein IDL intermediate density lipoprotein LDL low density lipoprotein NN neural network PCA principal component analysis PLS partial least squares RBF radial basis function VLDL very low density lipoprotein

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,193
Score d'incertitude au seuil0,431

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,270
Écart entre enseignants0,256 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle