Cloning and characterization of a gene coding for a class I chitin synthase from <i>Fusarium graminearum</i>
Notice bibliographique
Résumé
Abstract The full-length sequence of a gene coding for a class I chitin synthase (Chs) from Fusarium graminearum (Fg) was isolated by genome walking, using gene-specific primers and walking libraries constructed with a panel of eight restriction enzymes. Analysis of the gene (named FgChs1) and its corresponding cDNA revealed an open reading frame of 2703 bp interrupted by two introns of 120 and 55 bp, respectively. FgChs1 is a single-copy gene. Its deduced amino acid sequence shows 77% identity to Neurospora crassa Chs3 and 73% identity to Ophiostoma novo-ulmi ChsA in the conserved central region (residues 153 to 800). Quantitative reverse transcription – polymerase chain reaction was used to compare the levels of FgChs1 mRNA at different stages of development. This showed that FgChs1 was developmentally regulated, with peaks of expression during spore germination and mycelial growth. The first significant increase in FgChs1 mRNA levels was detected after 1 day of hyphal growth while the second peak was apparent after 5 days. This result suggests that FgChs1 may play an important role in fungal growth and development. Keywords: Fusarium graminearumchitin synthasequantitative reverse transcription – polymerase chain reactiongenome walking
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».