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Enregistrement W2050765086 · doi:10.1080/07060660309507076

Cloning and characterization of a gene coding for a class I chitin synthase from <i>Fusarium graminearum</i>

2003· article· en· W2050765086 sur OpenAlexvenueno aff
Heping Li, Cheng-Ying Fu, Dieter Peschen, Xingyuan Ling, Rainer Fischer, Yu‐Cai Liao

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Plant Pathology · 2003
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueStudies on Chitinases and Chitosanases
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésChitin synthaseBiologyGeneNeurospora crassaOpen reading frameGeneticsIntronCoding regionComplementary DNARapid amplification of cDNA endsSpore germinationMolecular biologyChitinPeptide sequenceMicrobiologyBiochemistrySpore

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract The full-length sequence of a gene coding for a class I chitin synthase (Chs) from Fusarium graminearum (Fg) was isolated by genome walking, using gene-specific primers and walking libraries constructed with a panel of eight restriction enzymes. Analysis of the gene (named FgChs1) and its corresponding cDNA revealed an open reading frame of 2703 bp interrupted by two introns of 120 and 55 bp, respectively. FgChs1 is a single-copy gene. Its deduced amino acid sequence shows 77% identity to Neurospora crassa Chs3 and 73% identity to Ophiostoma novo-ulmi ChsA in the conserved central region (residues 153 to 800). Quantitative reverse transcription – polymerase chain reaction was used to compare the levels of FgChs1 mRNA at different stages of development. This showed that FgChs1 was developmentally regulated, with peaks of expression during spore germination and mycelial growth. The first significant increase in FgChs1 mRNA levels was detected after 1 day of hyphal growth while the second peak was apparent after 5 days. This result suggests that FgChs1 may play an important role in fungal growth and development. Keywords: Fusarium graminearumchitin synthasequantitative reverse transcription – polymerase chain reactiongenome walking

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,026
Score d'incertitude au seuil0,372

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,206
Écart entre enseignants0,196 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2003
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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