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Structural basis for selective binding of m6A RNA by the YTHDC1 YTH domain

2014· article· en· 708 citations· W2050791777 sur OpenAlex· 10.1038/nchembio.1654

Pourquoi ce travail est-il dans la base ?

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

Affiliation canadienneUne personne signataire a déclaré un établissement canadien. C'est la seule voie dont dispose la base habituelle.
Organisme subventionnaire canadienUn organisme canadien l'a financé. Le travail peut ne porter aucune affiliation canadienne.

Prédiction du classificateur

metacan-v1-d91a1de5be90

Les prédictions imitent deux enseignants automatiques. Les scores ne sont pas des probabilités de prévalence calibrées.

Candidat du classificateur
Expérimental (laboratoire)Théorique ou conceptuelSans objet
Consensus du classificateur
Expérimental (laboratoire)
Scores d’imitation des enseignants

Codex

Expérimental (laboratoire)0,970
Autre devis0,028
Théorique ou conceptuel0,009
Observationnel0,004
Sans objet0,003
Science ouverte0,001
Métarecherche0,000
Communication savante0,000
Bibliométrie0,000
Intégrité de la recherche0,000
Simulation ou modélisation0,000
Études des sciences et des technologies0,000
Essai randomisé0,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,000
Étude de cas0,000
Qualitatif0,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,000
Essai non randomisé0,000
Revue systématique0,000
Méta-analyse0,000

Gemma

Expérimental (laboratoire)0,993
Sans objet0,115
Théorique ou conceptuel0,019
Observationnel0,001
Intégrité de la recherche0,000
Métarecherche0,000
Simulation ou modélisation0,000
Science ouverte0,000
Études des sciences et des technologies0,000
Bibliométrie0,000
Essai non randomisé0,000
Étude de cas0,000
Qualitatif0,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,000
Essai randomisé0,000
Communication savante0,000
Revue systématique0,000
Méta-analyse0,000

Scores machine (provisoires)

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,262
Écart entre enseignants
0,257 la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validation
score_only:v0-immature-baseline tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Résumé

N(6)-methyladenosine (m(6)A) is the most abundant internal modification of nearly all eukaryotic mRNAs and has recently been reported to be recognized by the YTH domain family proteins. Here we present the crystal structures of the YTH domain of YTHDC1, a member of the YTH domain family, and its complex with an m(6)A-containing RNA. Our structural studies, together with transcriptome-wide identification of YTHDC1-binding sites and biochemical experiments, not only reveal the specific mode of m(6)A-YTH binding but also explain the preferential recognition of the GG(m(6)A)C sequences by YTHDC1.

Récupéré depuis PubMed par NCBI EFetch. Les titres des sections structurées sont conservés.