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Enregistrement W2051085800 · doi:10.2174/138920111795909113

Harnessing Metabolomics for Nutrition Research

2011· review· en· W2051085800 sur OpenAlexaff
Michael A. Zulyniak, David M. Mutch

Notice bibliographique

RevueCurrent Pharmaceutical Biotechnology · 2011
Typereview
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMetabolomics and Mass Spectrometry Studies
Établissements canadiensUniversity of Guelph
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMetabolomicsComputational biologyComputer scienceData scienceBiologyBioinformatics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Comprehensive analytical technologies are rapidly becoming a cornerstone of modern nutritional sciences. Two of these technologies, mass spectrometry (MS) and nuclear magnetic resonance (NMR), have proven highly informative for the global analysis of metabolites, commonly referred to as metabolomics. Metabolomics provides a powerful approach to study small molecules in order to better understand the implications and subtle perturbations in metabolism triggered by nutrients. By studying how dietary molecules can modulate the metabolome, researchers have begun to elucidate the molecular pathways by which nutrients affect health and disease, expand the current state of knowledge regarding how inter-individual variability contributes to differences in nutrient metabolism, and develop novel avenues of research for nutritional sciences. Although metabolomics has been more commonly used to study disease states, its use in the nutritional sciences is gaining momentum. The current review is written for the clinical researcher wishing to incorporate metabolomics into dietary intervention studies. This review will highlight the importance and benefit of identifying biomarkers that accurately reflect changes in nutrient intake and metabolism, and present numerous issues that can introduce variability into a dataset and confound a study's biological interpretation, including sample population demographics, the biological specimen selected, diurnal variation, collection methods, and sample storage parameters. Considering these important areas at the experimental design stage will ensure that metabolomics provides a comprehensive and accurate assessment of the molecular impact of a dietary intervention.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,012

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,001
Bibliométrie0,0040,004
Études des sciences et des technologies0,0000,002
Communication savante0,0030,004
Science ouverte0,0010,002
Intégrité de la recherche0,0030,004
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,003

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,297
Tête enseignante GPT0,497
Écart entre enseignants0,200 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations19
Publié2011
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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