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Enregistrement W2051253171 · doi:10.1038/nm.3270

Endogenous factor VIII synthesis from the intron 22–inverted F8 locus may modulate the immunogenicity of replacement therapy for hemophilia A

2013· article· en· W2051253171 sur OpenAlexaff
Gouri Shankar Pandey, Chen Yanover, Lisa M. Miller-Jenkins, Susan H. Garfield, Shelley A. Cole, Joanne E. Curran, Eric K. Moses, Natalia Rydz, Vijaya L. Simhadri, Chava Kimchi‐Sarfaty, David Lillicrap, Kevin R. Viel, Teresa M. Przytycka, Glenn F. Pierce, Tom E. Howard, Zuben E. Sauna

Notice bibliographique

RevueNature Medicine · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueHemophilia Treatment and Research
Établissements canadiensQueen's University
Organismes subventionnairesU.S. National Library of MedicineNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesNational Heart, Lung, and Blood InstituteBaxter Healthcare CorporationNational Cancer InstituteNational Institutes of HealthBayer HealthCareUniversity of California, San FranciscoUniversity of Southern California
Mots-clésImmunogenicityLocus (genetics)IntronEndogenyImmunologyMedicineGenetic enhancementGeneticsBiologyVirologyGeneAntibodyInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Patients with hemophilia lacking functional coagulation factor VIII (FVIII) are treated with replacement FVIII proteins. The development of neutralizing antibodies to the replacement FVIII, a major clinical problem, depends on the nature of the mutation in the gene encoding FVIII. The authors find that a prevalent inversion allele can unexpectedly produce FVIII protein, explaining why individuals with this allele do not frequently develop neutralizing antibodies. Neutralizing antibodies (inhibitors) to replacement factor VIII (FVIII, either plasma derived or recombinant) impair the effective management of hemophilia A1. Individuals with hemophilia A due to major deletions of the FVIII gene (F8) lack antigenically cross-reactive material in their plasma (“CRM-negative”), and the prevalence of inhibitors in these individuals may be as high as 90%. Conversely, individuals with hemophilia A caused by F8 missense mutations are CRM-positive, and their overall prevalence of inhibitors is <10% (ref. 2). Individuals with the F8 intron 22 inversion (found in ∼50% of individuals with severe hemophilia A) have been grouped with the former on the basis of their genetic defect and CRM-negative status. However, only ∼20% of these individuals develop inhibitors3. Here we demonstrate that the levels of F8 mRNA and intracellular FVIII protein in B lymphoblastoid cells and liver biopsies from individuals with the intron 22 inversion are comparable to those in healthy controls. These results support the hypothesis that most individuals with the intron 22 inversion are tolerized to FVIII and thus do not develop inhibitors. Furthermore, we developed a new pharmacogenetic algorithm that permits the stratification of inhibitor risk for individuals and subpopulations by predicting the immunogenicity of replacement FVIII using, as input, the number of putative T cell epitopes in the infused protein and the competence of major histocompatibility complex class II molecules to present such epitopes. This algorithm showed statistically significant accuracy in predicting the presence of inhibitors in 25 unrelated individuals with the intron 22 inversion.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,121
Score d'incertitude au seuil0,999

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,033
Tête enseignante GPT0,299
Écart entre enseignants0,266 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations69
Publié2013
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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