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Enregistrement W2051387878 · doi:10.1128/jb.01252-12

Training the Biofilm Generation—a Tribute to J. W. Costerton

2012· article· en· W2051387878 sur OpenAlexaff
Robert McLean, Joseph S. Lam, Lori L. Graham

Notice bibliographique

RevueJournal of Bacteriology · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBacterial biofilms and quorum sensing
Établissements canadiensSt. Francis Xavier UniversityUniversity of Guelph
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyTributeBiofilmMicrobiologyComputational biologyBacteriaGeneticsArt history

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Although bacterial growth on surfaces was described by earlymicrobiologists, including Claude ZoBell (61), the term “bio-film ” (38) and the importance of adherent bacteria in nature and disease did not gain full prominence in the scientific community until the work of J. W. (Bill) Costerton’s group and the numerous laboratories that he collaborated with (11, 13, 16). During his lifetime (31), Bill’s boundless energy enabled him to push the concept of biofilms as a key to understanding how bacteria inter-act with the environment, be it rock surfaces, heat exchangers, medical devices, or human tissues. Bill was a highly effective com-municator through his prolific writing (more than 600 peer-re-viewed publications) and also through his public speaking, which conveyed exciting scientific concepts to audiences ranging from scientists to medical doctors, engineers, the U.S. Senate, and even the general public. For the past 2 decades, there have been numer-ous biofilm conferences, including the ones sponsored by the American Society for Microbiology (ASM), European and Asian microbiology societies, and biofilm research institutions and cen-ters around the world. Full validation that research on biofilms must be done was when the U.S. National Institutes of Health publicly announced, “Biofilms are medically important, account-ing for over 80 % of microbial infections in the body ” (program

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,018
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,042
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Commentaire · Signal consensuel: Commentaire
Score de désaccord entre enseignants0,018
Score d'incertitude au seuil0,093

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0180,042
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,001
Bibliométrie0,0020,001
Études des sciences et des technologies0,0050,006
Communication savante0,0080,011
Science ouverte0,0030,005
Intégrité de la recherche0,0090,032
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0100,005

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,037
Tête enseignante GPT0,274
Écart entre enseignants0,237 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreCommentaire

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations41
Publié2012
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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