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Enregistrement W2051613924 · doi:10.1021/bi801514e

Hydrophobic Core of the Steroidogenic Acute Regulatory Protein for Cholesterol Transport

2009· article· en· W2051613924 sur OpenAlexaff
Himangshu S. Bose, Randy M. Whittal, Mahuya Bose, Dilip Kumar Debnath

Notice bibliographique

RevueBiochemistry · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineMaterials Science
ThématiqueEnzyme Structure and Function
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesEunice Kennedy Shriver National Institute of Child Health and Human Development
Mots-clésMutantWild typeSteroidogenic acute regulatory proteinChemistryCholesterol side-chain cleavage enzymeBiochemistryMolecular biologyBiophysicsBiologyGeneMessenger RNA

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The steroidogenic acute regulatory protein (StAR), the first family member of START (StAR-related lipid transport) proteins, plays an essential role by facilitating the movement of cholesterol from the outer to inner mitochondrial membrane. Wild-type and mutant StAR binds cholesterol with similar intensity, but only wild-type StAR can transport it to mitochondria. Here, we report that the hydrophobic core is crucial for biological activity of proteins with START domains. Wild-type StAR increased steroidogenic activity by 7-9-fold compared to mutant R182L StAR, but both of them showed similar near-UV CD spectra. The fluorescence maximum of wild-type StAR is red shifted in comparison to mutant StAR under identical urea concentration. TFE increased the alpha-helical contribution of wild-type StAR more than the mutant protein. Acrylamide quenching for the wild-type protein (K(SV) = 12.0 +/- 0.2-11.2 +/- 0.5 M(-1)) exceeded that of the mutant protein (K(SV) = 4 +/- 0.2 M(-1)). Consistent with these findings, the hydrophobic probe ANS bound wild-type StAR (K(app) = 8.1 x 10(5) M(-1)) to a greater degree than mutant StAR (K(app) = 3.75 x 10(5) M(-1)). Partial proteolysis examined by mass spectrometry suggests that only wild-type StAR has a protease-sensitive C-terminus, but not the mutant. Stopped-flow CD revealed that the time of unfolding of mutant StAR was 0.017 s. In contrast, the wild-type StAR protein is unfolded in 16.3 s. In summary, these results demonstrate that wild-type StAR adopts a very flexible form due to the accommodation of more water molecules, while mutant StAR is generated by an alternate folding pathway making it inactive.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,221
Écart entre enseignants0,212 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations10
Publié2009
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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