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Biochemical analysis of theXenopus laevis TCR/CD3 complex supports the "stepwise evolution" model

2000· article· en· W2051822933 sur OpenAlexaff
Thomas Göbel, Erika L. Meier, Louis Du Pasquier

Notice bibliographique

RevueEuropean Journal of Immunology · 2000
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueImmune Cell Function and Interaction
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyT-cell receptorCD3Polyclonal antibodiesAntiserumXenopusMolecular biologyWestern blotImmunoprecipitationCD8T cellAntigenAntibodyBiochemistryGeneGeneticsImmune system

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The TCR/CD3 complex of a cold-blooded vertebrate, the amphibian Xenopus laevis, was biochemically characterized with a cross-reactive polyclonal antiserum recognizing a conserved epitope in the cytoplasmic domain of CD3E. The specificity and utility of this reagent was validated by Western blot analysis and immunoprecipitation of the well-characterized chicken TCR/CD3 complex. Cross-reactivity with the X. laevis CD3E protein was demonstrated by specific staining of sorted CD8+ cells. Immunohistology on both tadpoles and adult tissues suggests this antiserum will be instrumental in the localization of Xenopus T cells and most likely NK cells. Double staining of tissue sections with an anti-CD8 monoclonal antibody confirmed that this staining is specific. The antiserum was also used for the biochemical analyses of X. laevis TCR/CD3 complex. The 75-kDa alphabeta TCR heterodimer could be separated into a 40-kDa acidic TCR alpha chain and a 35-kDa basic TCR beta chain. Two CD3 proteins, both comigrating at approximately 19 kDa, were associated with the TCR heterodimer. Removal of N-linked carbohydrates yielded CD3 proteins of 19 kDa and 16.5 kDa, most likely representing the CD3epsilon and CD3gamma/delta homologues, respectively. An additional band of 110 kDa represents a multimeric complex of the TCR heterodimer covalently linked to a CD3 dimer. These properties of the Xenopus TCR/CD3 complex substantiate a stepwise evolutionary model for the CD3 protein family.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,834
Score d'incertitude au seuil0,992

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0090,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,226
Écart entre enseignants0,212 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations39
Publié2000
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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