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Enregistrement W2052591253 · doi:10.1093/neuonc/nou254.16

EG-16 * ABERRANT Myst4/Brpf1 SIGNALING MISDIRECTS REGIONAL NEUROGENESIS PROGRAMS, SUSTAINING EXPRESSION OF SELF-RENEWAL GENES IN PEDIATRIC BRAIN CANCERS

2014· article· en· W2052591253 sur OpenAlexaff
Timothy Van Meter, Asad Ullah Khan, K. Fitzmartin, Michael D. Taylor, Stephen C. Mack, Jacques Côté

Notice bibliographique

RevueNeuro-Oncology · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueProtein Degradation and Inhibitors
Établissements canadiensUniversité LavalHospital for Sick Children
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésNeurogenesisBiologyEpigeneticsChromatinNeural stem cellDNA methylationHistoneNeural developmentCancer researchGeneticsCell biologyGene expressionGeneStem cell

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The Myst family of acetyltransferase proteins has been shown to play important role in development and self-renewal, primarily through lysine acetylation on Histones H3 and H4. In neural development, Myst4 (Morf/KAT6B) has been found to be critical for self-renewal and for neuron generation in the developing nervous system and during adult neurogenesis. This chromatin modifier exists in a complex with Myst3 (Moz/KAT6A), the bromodomain factor Brpf1, which acts as a protein scaffold, targeting histone acetyltransferases to chromatin, as well as Inhibitor of Growth 5 (ING5) and Esa1-associated factor 6 (EAF6). Our laboratories have found alteration of these elements in pediatric brain cancers, suggesting a pathological role in abnormal neural progenitor growth. Exon-specific microarrays, DNA methylation studies and functional perturbation were performed to study the impact on tumor behavior. RNA interference in tumors and neural progenitors led to loss of H3K4acetylation in target genes and altered expression, including Spondin-1. Conversely, exogenous over-expression of targeting factors, such as Brpf1, enhanced expression of target genes, assessed by quantitative PCR analysis. Furthermore, expression of Myst3/4 and Brpf1 positively correlated with tumor malignancy markers in large patient cohorts, including Ki67, PCNA, and MELK, and with decreased overall survival. Assessment of direct functional relationships with tumor markers using ChIP-Seq approaches is currently being pursued to investigate direct Myst3/4/Brpf1-mediated promoter activity at known and novel target genes. These studies aim to elucidate the role of an important epigenetic mechanism in neurogenesis, the alteration of which may underlie global chromatin changes that contribute to tumor growth or initiation. Sustained progenitor growth may be suppressed by targeted therapies that disrupt these factors.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,263
Écart entre enseignants0,248 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2014
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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