Monoclonal antibodies reveal the alteration of the rhodocetin structure upon α2β1 integrin binding
Notice bibliographique
Résumé
The α2β1 antagonist rhodocetin from Calloselasma rhodostoma is a heterotetrameric CLRP (C-type lectin-related protein) consisting of four distinct chains, α, β, γ and δ. Via their characteristic domain-swapping loops, the individual chains form two subunits, αβ and γδ. To distinguish the four chains which share similar molecular masses and high sequence homologies, we generated 11 mAbs (monoclonal antibodies) with different epitope specificities. Four groups of distinct mAbs were generated: the first targeted the rhodocetin β chain, the second group bound to the αβ subunit mostly in a conformation-dependent manner, the third group recognized the γδ subunit only when separated from the αβ subunit, whereas a fourth group interacted with the γδ subunit both in the heterotetrameric molecule and complexed with the integrin α2 A-domain. Using the specific mAbs, we have shown that the rhodocetin heterotetramer dissociates into the αβ and γδ subunit upon binding to the integrin α2 A-domain at both the molecular and cellular levels. After dissociation, the γδ subunit firmly interacts with the α2β1 integrin, thereby blocking it, whereas the rhodocetin αβ subunit is released from the complex. The small molecular interface between the αβ and γδ subunits within rhodocetin is mostly mediated by charged residues, which causes the two dissociated subunits to have hydrophilic surfaces.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».