Interaction between calf thymus DNA and cationic bottle-brush copolymers: equilibrium and stopped-flow kinetic studies
Notice bibliographique
Résumé
Interaction studies between a set of poly(ethylene glycol) (PEG) based cationic bottle-brush block copolymers (BBCPs) and calf thymus DNA (ctDNA) were carried out using steady state fluorescence spectroscopy, UV melting experiments and dynamic light scattering measurements. Results suggested that these cationic block copolymers could effectively bind with negatively charged DNA. Although electrostatic interaction is believed to be the predominant contributing factor in the overall binding process, hydrophobic interactions between the PEG chains and the DNA base pairs affected the binding process to some extent. Cationic block copolymers with higher PEG content were found to bind more efficiently with DNA. DLS studies revealed the details of the compaction process of elongated DNA chains into a globular structure in the presence of cationic block copolymers. Further, the kinetics of the DNA-cationic BBCP binding process was monitored via the stopped-flow fluorescence technique. In general, a two-step mechanistic pathway was observed in the case of all the cationic BBCP-DNA binding processes and the relative rate constants (k1'and k2') were found to increase with the copolymer concentration. The first step corresponded to a fast electrostatic binding between the cationic BBCP and the anionic ctDNA, while the slow second step indicated a conformational change of the DNA polyplex that led to DNA compaction. In addition to the polymer-DNA charge ratios, the PEG content in the cationic BBCPs was found to have a significant effect on the kinetics of the ctDNA-BBCP polyplex formation.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».