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Enregistrement W2053248846 · doi:10.1074/jbc.m502347200

Identification of the VirB4-VirB8-VirB5-VirB2 Pilus Assembly Sequence of Type IV Secretion Systems

2005· article· en· W2053248846 sur OpenAlexafffund
Qing Yuan, Anna Carle, Chan Gao, Durga Sivanesan, Khaled A. Aly, Christoph Höppner, Lilian Krall, Natalie Domke, Christian Baron

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2005
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBacterial Genetics and Biotechnology
Établissements canadiensMcMaster University
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCanadian Institutes of Health ResearchEuropean CommissionMcMaster University
Mots-clésPilusSecretionBiologyBacterial outer membraneAgrobacterium tumefaciensCell biologyVirulencePilinType three secretion systemBiochemistryGeneEscherichia coli

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Type IV secretion systems mediate the translocation of virulence factors (proteins and/or DNA) from Gram-negative bacteria into eukaryotic cells. A complex of 11 conserved proteins (VirB1-VirB11) spans the inner and the outer membrane and assembles extracellular T-pili in Agrobacterium tumefaciens. Here we report a sequence of protein interactions required for the formation of complexes between VirB2 and VirB5, which precedes their incorporation into pili. The NTPase Walker A active site of the inner membrane protein VirB4 is required for virulence, but an active site VirB4 variant stabilized VirB3 and VirB8 and enabled T-pilus formation. Analysis of VirB protein complexes extracted from the membranes with mild detergent revealed that VirB2-VirB5 complex formation depended on VirB4, which identified a novel T-pilus assembly step. Bicistron expression demonstrated direct interaction of VirB4 with VirB8, and analyses with purified proteins showed that VirB5 bound to VirB8 and VirB10. VirB4 therefore localizes at the basis of a trans-envelope interaction sequence, and by stabilization of VirB8 it mediates the incorporation of VirB5 and VirB2 into extracellular pili.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,008
Score d'incertitude au seuil0,377

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,019
Tête enseignante GPT0,255
Écart entre enseignants0,235 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations112
Publié2005
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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